Sequenciamento completo do trio do genoma como um teste de rotina padrão em pacientes com doenças raras - "GENOME FIRST APPROACH"

No projeto GENOME FIRST APPROACH (monocêntrico, prospectivo, diagnóstico aberto), pacientes com doenças molecularmente não diagnosticadas serão analisados ​​diagnosticamente por análise de trio de Sequenciamento do Genoma Total (WGS). As seguintes perguntas guiarão o projeto:

Primário:

• Eficácia da análise do trio WGS em diferentes indicações clínicas

Secundário:

• Avalie sistematicamente a análise WGS para detectar variações genéticas em comparação com WES e análise de matriz de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP),
• Expanda a análise da codificação de variantes de nucleotídeo único (SNVs) para mutações regulatórias, variantes estruturais (SVs) e regiões de baixa complexidade,
• Validar a eficácia do sequenciamento do trio do genoma clínico em um ambiente de diagnóstico de rotina,
• Analisar se a cobertura 42x tem potencial para descobrir o mosaicismo como mecanismo causador de doenças,
• Desenvolver algoritmos adicionais para análises integrativas de dados Trio-WGS com sequenciamento de ácido ribonucleico (RNA-seq),
• Identificar alterações de novo e novos mecanismos de doença,
• Obtenha novos insights fundamentais sobre mecanismos de doenças e biologia celular,
• Combine o WGS com outros métodos Omics para melhorar o diagnóstico genético de futuros pacientes com doenças raras e
• Explore os custos financeiros gerais e o tempo para relatar dados conclusivos aos pacientes da abordagem Trio-WGS em comparação com as abordagens tradicionais de diagnóstico em várias etapas usando sequenciamento de gene único, painel, exoma completo (WES) e microarray cromossômico (CMA) (array SNP, array análise baseada em hibridização genômica comparativa (arrayCGH)).

Além disso, os pais saudáveis ​​dos sujeitos serão incluídos no projeto para realizar análises pai-filho (trio).