Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Genomsekvenseringsstrategier for genetisk diagnose av pasienter med intellektuell funksjonshemming (DEFIDIAG)

Etude Pilote Des différentes stratégies de séquençage Haut débit du génome Pour le Diagnostic génétique Des Patients Atteints de déficience Intellectuelle

Introduksjon: Intellektuell funksjonshemming (ID) er den vanligste årsaken til henvisning i de pediatriske genetiske sentrene og kjennetegnes av en ekstrem genetisk heterogenitet tilsvarende et utall av sjeldne sykdommer som kompliserer identifiseringen av ID-er.

Totalt i dag i Frankrike, for ikke-syndromiske ID-affekterte pasienter, fører Fra-X-deteksjonen, den kromosomale mikroarray-analysen og genpanelstrategien for 44 ID-utvalgte gener til et globalt diagnostisk utbytte for 1/3 pasienter, noe som etterlater 2/3 av pasientene fortsatt uten diagnose.

Fremkomsten og utbruddet av Next Generation Sequencing (NGS)-teknologier har klart revolusjonert tilnærmingene til diagnose og forskning innen sjeldne sykdommer på en internasjonal internasjonal måte. Det er derfor hovedhypotesen til DEFIDIAG er at Whole Genome Sequencing (WGS) kan gjøre det mulig å forbedre den diagnostiske ytelsen og kostnadseffektiviteten for franske pasienter med ID.

Mål: Hovedmålet med denne studien er å sammenligne prosentandelen av genetisk kausal diagnose identifisert hos ID-pasienter ved å utføre trio WGS-analyse kontra bruken av den gjeldende franske referansestrategien (ACPA, X-Fra, DI 44).

Metoder og design : Dette er en prospektiv studie. Etterforskerne forventer å inkludere 1275-indekstilfelle med hans/hennes 2 biologiske upåvirkede foreldre.

Studieoversikt

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Faktiske)

3825

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

      • Angers, Frankrike, 49000
        • CHU d'Angers
      • Bordeaux, Frankrike
        • CHU Bordeaux
      • Bron, Frankrike
        • Hospices Civil de Lyon
      • Dijon, Frankrike
        • CHU Dijon
      • La Tronche, Frankrike, 38700
        • CHU de Grenoble-Alpes
      • Lille, Frankrike
        • CHRU Lille
      • Marseille, Frankrike
        • Assistance Publique - Hopitaux de Marseille
      • Montpellier, Frankrike
        • Chu Montpellier
      • Nantes, Frankrike
        • CHU Nantes
      • Paris, Frankrike
        • Assistance publique - Hôpitaux de Paris - Groupe Hospitalier Pitié Salpétrière
      • Paris, Frankrike
        • Assistance publique - Hôpitaux de Paris - Hôpital Necker - Enfants malades
      • Rennes, Frankrike
        • CHU Rennes
      • Rouen, Frankrike
        • CHU Rouen
      • Strasbourg, Frankrike
        • CHU Strasbourg

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Ja

Beskrivelse

  1. Inklusjonskriterier for barn eller voksne med ID av ukjent etiologi (indekstilfelle)

    For å være kvalifisert til å delta i denne studien, må en person oppfylle alle følgende kriterier:

    • Alder:

      1. Mellom 0 og 5 år med strenge kriterier (alvorlig forsinket utvikling når det gjelder motoriske ferdigheter, språk og/eller sosialitet) ELLER
      2. ≥ 6 år: pasienter med ID, uansett alvorlighetsgrad (men med påvist ID ved ad hoc nevropsykologisk testing) og tilhørende manifestasjoner
    • Uten noen åpenbar diagnose identifisert under en genetisk konsultasjon i et av de deltakende sentrene (dvs. et åpenbart syndrom med ID med velkjent molekylær diagnose er ekskludert);
    • Levering av signert og datert "deltaker" samtykkeskjema;
    • Erklært vilje til å overholde alle studieprosedyrer og tilgjengelighet under studiets varighet.

    Pasient med trygd i samsvar med fransk lov (bestemmelser knyttet til forskning som involverer en menneskelig person gitt i artikkel L 1121-1 ff. i den franske folkehelseloven).

  2. Inklusjonskriterier for biologiske foreldre

    - Utlevering av underskrevet og datert samtykkeskjema for begge foreldrene.

  3. Kriterier for ikke-inkludering

    • En person som presenterer ethvert forhold som etter etterforskerens mening gjør det uønsket for forsøkspersonen å delta i rettssaken eller som vil sette overholdelse av protokollen i fare, vil ikke være kvalifisert;
    • Pasienter med isolerte lærevansker;
    • En eller begge foreldre med ID;
    • Forelder plassert under rettslig beskyttelse (tutelle, curatelle et sauvegarde de justice);
    • Pasient med kjent etiologisk diagnose (ikke-genetisk, tidligere påvist Fra-X-syndrom, kjenner til kromosomavvik, kjent patogen eller sannsynligvis patogen variant identifisert i et ID-gen ved hjelp av en hvilken som helst teknikk).
    • For pasient angående biobankprosjekt: overfølsomhet for lokalbedøvelse

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
  • Masking: Enkelt

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Diagnostisk utbytte
Tidsramme: 12 måneder
Det primære studieendepunktet er identifisering av en årsaksdiagnose av ID definert som identifisering av en klasse 4 eller 5 variant (eller to i tilfelle autosomal recessiv arv) som forklarer symptomene som pasienten presenterer. I tillegg vil varianter klassifisert som 3+, som forventes å bli fremtidig 4, bli registrert. Spesifikk analyse og oppfølging av varianten klassifisert som 3+ (dvs. med høy sannsynlighet for patogenisitet) vil bli gjort etter slutten av protokollen for å bestemme klasse 3+ til klasse 4-5 bytteforhold og for å beskrive de nye genene/ mekanismer involvert i ID og avslørt av DEFIDIAG.
12 måneder

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Årsaksmessig strukturendring
Tidsramme: 12 måneder

Identifikasjon av kausale strukturelle endringer (CNV, translokasjon, inversjon) i den første undersøkelsespopulasjonen (bekreftet under MDM for WGS-strategiene)

De kliniske egenskapene til pasientene og det diagnostiske utbyttet ved hvert trinn av den inkrementelle seleksjonen innen WGS-analyser (44GPS, OMIMOME, WES, WGS) i henhold til resultatene fra det foregående trinnet samt i henhold til resultatene av kromosomal mikroarray-analyse og 44GPS vil også være parametere av interesse for hele befolkningen.

12 måneder
Inkrementelt kostnadseffektivitetsforhold
Tidsramme: 24 måneder
Endepunktet for kostnadseffektivitet vil være et effektivitetskriterium basert på estimering av et inkrementelt kostnadseffektivitetsforhold, uttrykt i form av kostnad per ekstra positiv diagnose.
24 måneder
Gjennomsnittlig kostnad for vaklende diagnostisk forskning
Tidsramme: 24 måneder
Estimering av kostnadene ved vaklende diagnostisk forskning
24 måneder
Prosentandel av minst én modifikasjon i medisinsk, medisinsk-sosial, rehabiliterende og psykologisk oppfølging
Tidsramme: 24 måneder
24 måneder
Antall og type sekundærdata
Tidsramme: 12 måneder
Antall og type SF-er (klasse 4 eller 5 mutasjon(er)) identifisert hos foreldrene som spesifikt samtykker til denne studien, vil bli registrert i en spesifikk rapport. Resultatet vil bli definert av prosentandelen av SFer i den studerte populasjonen og antall og type medisinske konsekvenser etter identifisering.
12 måneder
Mediantid og type ferdigheter som kreves for å analysere genetiske data og for genetisk bekreftelse
Tidsramme: 12 måneder
12 måneder
Median tid for å oppnå resultater
Tidsramme: 12 måneder
12 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Hélène DOLLFUS, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale, France

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

13. mars 2020

Primær fullføring (Faktiske)

31. desember 2023

Studiet fullført (Antatt)

1. desember 2024

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

29. oktober 2019

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

4. november 2019

Først lagt ut (Faktiske)

7. november 2019

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Antatt)

5. mars 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

4. mars 2024

Sist bekreftet

1. mars 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

produkt produsert i og eksportert fra USA

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Intellektuell funksjonshemming

  • Sanford Health
    National Ataxia Foundation; Beyond Batten Disease Foundation; Pitt Hopkins... og andre samarbeidspartnere
    Rekruttering
    Mitokondrielle sykdommer | Retinitis Pigmentosa | Myasthenia Gravis | Eosinofil gastroenteritt | Multippel systematrofi | Leiomyosarkom | Leukodystrofi | Anal fistel | Spinocerebellar ataksi type 3 | Friedreich Ataxia | Kennedy sykdom | Lyme sykdom | Hemofagocytisk lymfohistiocytose | Spinocerebellar ataksi type 1 | Spinocerebellar... og andre forhold
    Forente stater, Australia

Kliniske studier på Trio hele genomsekvensering

3
Abonnere