Coronavírus estudado por metagenômica em pacientes com SDRA COVID-19 (COMETS)

A infecção respiratória pandêmica por SARS-CoV-2 (COVID-19) é responsável por mais de 4.000 mortes, principalmente (67%) secundárias a síndromes do desconforto respiratório agudo (SDRA). A SDRA costuma estar associada a uma mortalidade em torno de 40%, mas essa taxa chega a 61% em pacientes infectados pelo SARS-CoV-2. Dois endótipos foram descritos em pacientes com SDRA: um, hiperinflamatório, associado a mortalidade muito alta (51%); a segunda, levemente inflamatória (imunoparalisia), associada a mortalidade bem menor (19%). Em pacientes com COVID-19, perfis distintos de resposta imune também foram observados. Alguns doentes apresentam linfopenia profunda e/ou excreções virais prolongadas associadas a ocorrência mais frequente de co-infecções (+ 29% de vírus, + 23% de bactérias, + 10% de fungos). O último grupo pode estar em maior risco em termos de mortalidade. A intensidade da resposta inflamatória e/ou coinfecções microbianas aparecem, portanto, como fatores de risco de gravidade e mortalidade em pacientes infectados com SARS-CoV-2 que determinam o curso da doença. Para adaptar o manejo terapêutico ideal precoce a cada uma das formas da doença, é essencial poder caracterizar esses perfis no nível microbiológico e inflamatório.

Com uma rede comprometida de 6 unidades de terapia intensiva no leste e norte de Ile-de-France, 180 pacientes com SDRA e infectados com SARS-CoV-2 estão sendo inscritos. Para esses pacientes, um swab nasofaríngeo é coletado na inclusão; seguido de novo swab nasofaríngeo e amostra respiratória profunda uma vez por semana, até D28, para exploração de co-infecções e monitoramento da carga viral de SARS-CoV-2. O restante de cada uma dessas amostras é coletado para o estudo. Paralelamente, os dados clínicos habitualmente recolhidos no contexto dos cuidados intensivos serão recolhidos num CRF. Eles permitirão calcular pontuações de risco, como SOFA.