Detekce MRD pomocí NGS u pediatrické B-ALL

Design studie, pacienti a postupy Jednalo se o prospektivní, jednocentrickou, observační studii prováděnou u dětí s ALL mezi listopadem 2018 a červnem 2022. Do této studie byly zahrnuty děti s nově diagnostikovanou B-ALL, které podstoupily NGS receptorů B-buněk v Dětské nemocnici lékařské fakulty univerzity Zhejiang.

Pro diagnostiku a klasifikaci ALL v této studii byla použita kritéria Evropské skupiny pro imunologickou charakterizaci leukémií (EGIL). Všichni zařazení pacienti byli léčeni podle protokolu ZJCH-ALL-2019 uvedeného v doplňkovém souboru. Tento protokol byl v našem centru implementován v září 2018 a následně v roce 2019 rozšířen na celou provincii Zhejiang. V tomto protokolu nebyla NGS-MRD použita pro stratifikaci rizika pacienta nebo alokaci léčby. Pro detekci MRD byla při diagnóze odebrána aspirace kostní dřeně (BM) pro Ig NGS, konec indukce (EOI) v 5. týdnu od počáteční prednisonové prefáze a konec konsolidace (EOC) ve 13. byla před zahájením časné intenzifikace u pacientů s nízkým a středním rizikem a byla před zahájením druhého cyklu konsolidace u pacientů s vysokým rizikem. NGS-MRD byla postupně monitorována každé 2 až 3 měsíce po konsolidaci, dokud nebyla nedetekovatelná. V této studii se NGS-MRD vztahuje ke kvantitativní hodnotě MRD zjištěné pomocí testování NGS, což byl součet hladin IGH a lehkého řetězce (IGK/IGL). Detekce NGS během jiných časových bodů, jako je mezidobí indukce a časové body po negativním NGS-MRD, nebyla povinná, ale byla sledována podle preferencí rodičů. Pacienti byli sledováni do 30. srpna 2022 a medián doby sledování byl 20,7 měsíce.

Statistická analýza Asociace mezi kategorickými proměnnými byla testována pomocí χ2 testu, korelace mezi kvantitativními proměnnými byla měřena pomocí Pearsonovy korelace a testována pomocí Studentova t distribuce a pro srovnání kvantitativních proměnných byla použita ANOVA. Křivky přežití bez příznaků (EFS) a celkového přežití (OS) byly odhadnuty pomocí Kaplan-Meierovy metody a porovnány podle log rank testu. Za události při výpočtu pravděpodobnosti EFS byly považovány úmrtí během indukce, opuštění před kompletní remisí, úmrtí v kontinuální kompletní remisi, relaps a sekundární malignity. Čas EFS byl počítán od data diagnózy do posledního data sledování nebo první události. OS byl počítán od data diagnózy do úmrtí z jakýchkoliv příčin s cenzurou živých pacientů v době analýzy dat. Konečné datum pro následnou kontrolu bylo 30. srpna 2022. Vizualizace dat byla provedena pomocí R balíčku ggplot2 (verze 4.0.3) a GraphPad Prism 9.0.0. Statistická analýza byla provedena na R (verze 4.0.3). Hodnota P <0,05 (2 tailed) byla považována za statisticky významnou.