Proteomisk karakterisering af aggressive oligodendrogliomer (PROGLIO)

Oligodendrogliomer repræsenterer en særskilt undergruppe af voksne gliomer karakteriseret ved specifikke molekylære ændringer (1p/19q-kodeletion, mutationer af IDH, TERT-promotor, CIC, FUBP1). Disse tumorer tegner sig for 5 til 10 % af voksne gliomer og er af særlig relevans inden for det neuro-onkologiske område på grund af deres hyppige kemosensitivitet (Louis et al. 2016). Genetikken for oligodendrogliomer er relativt velkarakteriseret, men mekanismerne for onkogenese for disse tumorer er dårligt forstået.

Selvom prognosen for oligodendrogliomer normalt er bedre end andre undertyper af gliomer hos voksne, forbliver den heterogen, og der er ingen effektiv behandling ved tilbagefald efter strålebehandling og kemoterapi. Vores seneste arbejde udført inden for det INCa-finansierede nationale POLA-netværk har relateret denne kliniske heterogenitet til intertumoral heterogenitet. Baseret på en transkriptomisk analyse af en stor serie af oligodendrogliale gliomer identificerede vi 3 undergrupper, hvor den mest aggressive gruppe var karakteriseret ved aggressivt klinisk og molekylært mønster. Nylige undersøgelser har imidlertid vist et relativt lavt niveau af overensstemmelse mellem mRNA og proteinekspression, hvilket understreger behovet for at bruge proteomisk-baserede tilgange til bedre at forstå tumorbiologi. Ved at drage fordel af POLA-kohorten foreslår vi at udvide vores tidligere analyse ved at integrere en proteomisk analyse af oligodendrogliomer.

Målet med dette projekt er at identificere drivere for oligodendrogliom undergrupper, blandt hvilke potentielle lægelige mål (dvs. receptorer, metabolisme effektorer). Til dette formål vil de proteomiske profiler af 90 oligodendrogliomer blive genereret og integreret med transkriptomiske, genomiske og methyleringsprofiler for at identificere signalveje, der er specifikt forbundet med hver undertype, især med den mest aggressive. Forbindelser vil blive undersøgt mellem ekspression af kandidatsignalveje og kliniske resultater (overlevelse, progressionsfri overlevelse, objektiv respons). Relevansen af ​​de 2 mest lovende kandidat-signalveje vil blive vurderet in vitro og in vivo ved hjælp af genetisk relevante muse- og xenograft-modeller.

Vores projekt vil identificere målrettede onkogene veje forbundet med dårlig prognose, der kan føre til nye terapeutiske strategier.