Optimering af sepsisterapi baseret på patientspecifik digital præcisionsdiagnostik (DigiSep)

Sepsis er en sygdom, der udløses af en infektion og repræsenterer en af ​​de største udfordringer for moderne intensivmedicin. Med hensyn til målrettet antimikrobiel terapi er den tidligst mulige patogendetektion af afgørende betydning. Indtil nu har kulturbaserede detektionsmetoder repræsenteret guldstandarden for diagnose, selvom adskillige begrænsninger karakteriserer disse. I denne sammenhæng er kulturuafhængige molekylærbiologiske processer et alternativ. Især ser konceptet med serumdetektion af cirkulerende, frit DNA ved brug af næste generations sekventering (NGS) ud til at repræsentere en lovende diagnostisk procedure hos patienter med blodbaneinfektioner. Ansøgerens omfattende forarbejde tyder på, at NGS-baseret diagnostik ved brug af SIQ-scoren har højere specificitet og sensitivitet sammenlignet med traditionelle kulturbaserede metoder til påvisning af blodbaneinfektioner. Dette forarbejde til DigiSep-forsøget ved hjælp af interventionelt studiedesign giver det optimale grundlag for at etablere dette nye koncept som en del af den nationale standard baseret på den bedst mulige evidens. DigiSep-forsøget har til formål at karakterisere effekten af ​​kombinationen af ​​digital præcisionsdiagnostik, ekspertudveksling og kulturbaseret standarddiagnostik sammenlignet med en rent kulturbaseret konventionel diagnose i det kliniske billede af sepsis/septisk shock. Studiet undersøger hos 410 patienter (n = 205 pr. arm) med sepsis/septisk shock, om den såkaldte DOOR-RADAR score (Desirability of Outcome Ranking / Response Adjusted for Duration of Antibiotic Risk Score) kan forbedres væsentligt, ved anvendelse af NGS. Vi tilstræber også at undersøge, om den nye procedure er omkostningseffektiv. Det postuleres, at indlæggelsestiden, dødeligheden, forekomsten af ​​akut nyresvigt (ARF), varigheden af ​​antimikrobiel behandling samt omkostningerne til komplikationer og ambulant efterbehandling kan reduceres. Der kan også forventes en væsentlig forbedring af livskvaliteten for de berørte patienter.

Som en del af undersøgelsen indsamles de væsentlige data én gang på tidspunktet for sepsis (= debut). Den dyrkningsbaserede diagnostik omfatter den guideline-orienterede indsamling af 2 bloddyrkningssæt (2 x aerob / 2 x anaerob) til starten og tre dage senere. Samtidig udtages serumprøver til NGS-baseret patogendiagnostik. Yderligere prøveudtagning til NGS-baseret diagnostik kan foretages op til dag 14 efter debut, eller når den behandlende læge fastslår en klinisk indikation for indsamling af yderligere blodkulturer. De førnævnte kulturer vs NGS-baseret patogendiagnostik er også ledsaget af udvidet immunologisk overvågning fra blodplasmaprøver samt en NGS-baseret transkriptomanalyse. Den tilknyttede prøvetagning finder sted på tidspunktet for debut, 3, 7 og 14 dage efter begyndelsen af ​​sepsis. Rutinemæssige mikrobiologiske fund fra andre biologiske prøver (f.eks. kirurgiske podninger, drænsekret, trakealsekret, vævsprøver) indgår i evalueringen, hvis disse er indsamlet tre dage før eller efter ekstraktion af serumprøver til NGS-baseret diagnostik. Den kliniske dataindsamling udføres også på tidspunktet for sepsis (= debut), 3, 7 og 14 dage senere, analogt med den ovennævnte prøveindsamling. Den endelige resultatevaluering finder sted 28 dage (= 28 d) efter starten af ​​sepsis. Den undersøgelsesrelaterede byrde på den enkelte undersøgelsespatient omfatter i alt 17 ml fuldblod til NGS-baseret diagnostik, de fire prøver på 7,5 ml fuldblod til immunologisk overvågning og de fire prøver på 2,7 ml fuldblod til transkriptomanalyse . Det mindste totale volumen svarer derfor til opsamling af ca. 75 ml fuldblod inden for de første 14 dage efter sepsis. Prøveudtagningen foregår med opsamling af blodkulturerne eller inden for rammerne af de daglige rutinemæssige blodprøver, således at der ikke er behov for yderligere venepunkteringer her. Infektionsparametre såsom procalcitonin (PCT) udføres inden for rammerne af daglig regelmæssig blodopsamling og kræver derfor ingen yderligere vaskulære punkteringer. Det samme princip gælder for indsamling af blodkulturer, som rutinemæssigt opnås som led i standarddiagnostik hos patienter med mistænkt eller påvist sepsis. De nødvendige blodprøver på to 40 ml fuldblod (hvert to sæt 2 x aerob / 2 x anaerob = 4 x 10 ml = 40 ml) repræsenterer derfor ikke nogen yderligere belastning på grund af undersøgelsen. En yderligere ekstra belastning for patienten vedrørende invasive procedurer eller undersøgelser forventes ikke i undersøgelsen.