Methodenvergleichsstudie des Spartan FRX CYP2C19-Genotypisierungssystems gegen bidirektionale Sequenzierung

Das Spartan FRX CYP2C19-Testsystem (im Folgenden als „FRX-System“ bezeichnet) ist ein qualitativer In-vitro-Diagnosetest zur Identifizierung der CYP2C19 *2-, *3- und *17-Genotypen eines Patienten anhand genomischer DNA, die aus Wangenabstrichproben gewonnen wurde.

Das FRX-System besteht aus Hardware- und Verbrauchskomponenten. Die Hardwarekomponenten des Systems umfassen einen Analysator (Thermocycler mit Fluoreszenzdetektionsfähigkeit), einen Netbook-Computer und einen Drucker. Die Verbrauchskomponente des FRX-Systems ist ein Probenentnahmekit. Jedes Kit enthält einen Wangenabstrich (zur Entnahme der Patientenprobe) und ein Röhrchen mit den Reagenzien, die für die genomische DNA-Extraktion und die PCR-Amplifikationsphasen des Tests erforderlich sind.

Das Spartan FRX System kann in jedem durchgeführten Test drei CYP2C19-SNPs (*2, *3, *17) erkennen. Für jeden getesteten SNP ist ein individuelles Probenentnahmekit erforderlich; daher sind für jeden auf dem System durchgeführten Test drei Probenentnahmekits erforderlich.

Das FRX-System darf nur von geschultem Personal in CLIA-zertifizierten Labors verwendet werden und ist für die Verwendung mit direkt von Patienten entnommenen Mundproben vorgesehen. Der FRX CYP2C19-Test soll es Klinikern ermöglichen, Patienten mit Mutationen in den *2-, *3- und *17-Loci des CYP2C19-Gens zu identifizieren, und ist zur Verwendung als Hilfe für Kliniker bei der Bestimmung von Strategien für Therapeutika indiziert, die durch CYP2C19 metabolisiert werden Genprodukt.

Um einen Test durchzuführen, entnimmt der Benutzer dem Patienten drei bukkale Proben und führt dann eine Probe in jedes der drei Reagenzröhrchen ein (eine für jeden der CYP2C19-Loci *2, *3 und *17). Die Reagenzienröhrchen werden in den Analysator eingesetzt und das FRX-System automatisiert die Prozesse der DNA-Extraktion, PCR-Amplifikation, Fluoreszenzsignaldetektion und Datenanalyse. Das System liefert dem Benutzer ein gedrucktes Ergebnis, das die Patienten-Genotypen an den Loci *2, *3 und *17 auflistet.

Diese Studie wurde entwickelt, um die Konkordanz (positive und negative prozentuale Übereinstimmung) durch den Vergleich des Spartan FRX-Systems mit der bidirektionalen DNA-Sequenzierung zu demonstrieren. Die Studie wird auch die Übereinstimmung zwischen drei verschiedenen Ausführungsformen des Probentransports bewerten, die den Labors zur Verwendung beim Transport der Reagenzröhrchen mit dem gesammelten Mundprobenabstrich zum Labor bereitgestellt werden.

Für jede Mutation wird die Übereinstimmung des FRX-Systems mit der bidirektionalen Sequenzierung (Vergleichsmethode) berechnet: Die Gesamtgenauigkeit des Tests wird wie folgt berechnet und angegeben:

• von übereinstimmenden Ergebnissen zwischen dem Test und der Referenzmethode Genauigkeit = -------------------------------------- --------------------------
• der nach der Referenzmethode analysierten Proben

Die Ergebnisse des ersten und zweiten Durchgangs der Studie werden analysiert und wie in der nachstehenden Tabelle dargestellt tabellarisch dargestellt. Als Akzeptanzkriterium für die Gesamtstudie gilt eine prozentuale Übereinstimmung ≥ 99,0 % für den zweiten Durchlauf mit der Untergrenze eines einseitigen 95 %-Konfidenzintervalls nach der Score-Methode ≥ 95,0 %.