Studio comparativo dei metodi del sistema di genotipizzazione Spartan FRX CYP2C19 rispetto al sequenziamento bidirezionale

Il sistema di test Spartan FRX CYP2C19 (di seguito denominato "Sistema FRX") è un test diagnostico in vitro qualitativo per l'identificazione dei genotipi CYP2C19 *2, *3 e *17 di un paziente dal DNA genomico ottenuto da campioni di tampone buccale.

Il sistema FRX è composto da hardware e componenti di consumo. I componenti hardware del sistema includono un analizzatore (termociclatore con capacità di rilevamento della fluorescenza), un computer netbook e una stampante. Il componente di consumo del sistema FRX è un kit di raccolta dei campioni. Ogni kit contiene un tampone buccale (utilizzato per raccogliere il campione del paziente) e una provetta contenente i reagenti necessari per l'estrazione del DNA genomico e le fasi di amplificazione PCR del test.

Il sistema Spartan FRX è in grado di rilevare tre SNP CYP2C19 (*2, *3, *17) in ciascun test eseguito. Per ogni SNP testato è richiesto un kit di raccolta campioni individuale; sono quindi necessari tre kit di prelievo campioni per ogni test eseguito sul sistema.

Il sistema FRX deve essere utilizzato da personale addestrato in laboratori certificati CLIA ed è destinato all'uso con campioni buccali prelevati direttamente dai pazienti. Il test FRX CYP2C19 ha lo scopo di consentire ai medici di identificare i pazienti con mutazioni nei loci *2, *3 e *17 del gene CYP2C19 ed è indicato per l'uso come ausilio ai medici nella determinazione delle strategie terapeutiche che vengono metabolizzate dal CYP2C19 prodotto genico.

Per eseguire un test, l'utente preleva tre campioni buccali dal paziente e quindi inserisce un campione in ciascuna delle tre provette di reagente (una per ciascuno dei loci CYP2C19 *2, *3 e *17). Le provette dei reagenti vengono inserite nell'analizzatore e il sistema FRX automatizza i processi di estrazione del DNA, amplificazione PCR, rilevamento del segnale fluorescente e analisi dei dati. Il sistema fornisce all'utente un risultato stampato che elenca i genotipi del paziente nei loci *2, *3 e *17.

Questo studio è stato progettato per dimostrare la concordanza (accordo percentuale positivo e negativo) confrontando il sistema Spartan FRX con il sequenziamento bidirezionale del DNA. Lo studio valuterà anche la concordanza tra tre diverse forme di realizzazione del trasporto del campione fornite ai laboratori per l'uso nel trasporto delle provette di reagente con il tampone del campione buccale raccolto al laboratorio.

Per ogni mutazione, verrà calcolata la concordanza del sistema FRX rispetto al sequenziamento bidirezionale (metodo comparativo): L'accuratezza complessiva del test verrà calcolata e riportata come segue:

• di risultati concordanti tra il test e il metodo di riferimento Accuratezza = -------------------------------------- --------------------------
• di campioni analizzati con il metodo di riferimento

I risultati di primo e secondo passaggio dello studio saranno analizzati e tabulati come indicato nella tabella sottostante. I criteri di accettazione per lo studio complessivo saranno una percentuale di accordo ≥ 99,0% per il secondo passaggio con il limite inferiore di un intervallo di confidenza unilaterale del 95% utilizzando il metodo del punteggio ≥ 95,0%.