Estudio de investigación sobre mutaciones patogénicas raras que causan diabetes tipo 2 y complicaciones (PreciDiag)

Procedimiento y metodología: durante una visita de seguimiento a su diabético habitual (en el CHU de Lieja), enviaremos a cada potencial voluntario, cumpliendo las condiciones de inclusión, un formulario de información y consentimiento relativo a los análisis genéticos. La participación en el protocolo es voluntaria, previa información detallada y discusión con el paciente. Una vez obtenido el acuerdo de participación, se tomará una muestra de sangre, que será la única muestra de todo el estudio.

Todos los tubos serán centrifugados, decantados, separados y congelados a -80 °C en el CHU de Lieja para la constitución de un banco de sueros in situ y de una biblioteca de ADN en UMR8199.

Para la extracción de ADN, las muestras se enviarán a -80 °C. La extracción de ADN será automatizada (Autopure, Qiagen).

Después de la extracción de ADN, los genes involucrados en la diabetes monogénica (Tabla 1) se secuenciarán a través de la captura de Twist o NimbleGen en combinación con la secuenciación de Illumina (NovaSeq 6000), según lo recomendado por Twist, NimbleGen e Illumina. El objetivo también incluirá genes involucrados en las formas raras de enfermedades metabólicas asociadas con la diabetes: obesidad, síndrome metabólico, hipercolesterolemia familiar, enfermedad renal, enfermedad cardiovascular y enfermedad del hígado graso no alcohólico. Esto ayudará a refinar la comprensión fenotípica del paciente y mejorar su atención.

Tabla 1. Lista de genes implicados en la diabetes monogénica

ID de gen ID de NM ABCC8 NM_000352.4 APPL1 NM_012096.2 NEGRO NM_001715.2 CEL NM_001807.4 DNAJC3 NM_006260.4 DYRK1B NM_004714.2 EIF2AK3 NM_004836.5 FOXP3 NM_014009.3 GATA4 NM_002052.3 GATA6 NM_005257.5 GCK NM_000162.3 GLIS3 NM_152629.3 HNF1A NM_000545.5 HNF1B NM_000458.3 HNF4A NM_175914.4 IER3IP1 NM_016097.4 SIN NM_000207.2 KCNJ11 NM_000525.3 KLF11 NM_003597.4 LRBA NM_6726.4 MAFA NM_201589.3 MNX1 NM_005515.3 MRAP2 NM_138409.3 NEUROD1 NM_002500.4 NEUROG3 NM_020999.3 NKX2-2 NM_002509.3 PAX4 NM_006193.2 PAX6 NM_000280.4 PCBD1 NM_000281.3 PDX1 NM_000209.3 PPP1R15B NM_032833.4 PTF1A NM_178161.2 RFX6 NM_173560.3 SLC19A2 NM_006996.2 SLC2A2 NM_000340.1 STAT3 NM_139276.2 TRMT10A NM_152292.4 WFS1 NM_006005.3 ZFP57 NM_001109809.2

Tras la secuenciación, las mutaciones se detectarán y anotarán de acuerdo con el protocolo bioinformático implementado y optimizado en UMR8199 desde 2009.

También se recogerán datos clínicos y médicos: peso, talla, tensión arterial, tratamiento farmacológico, antecedentes médicos y quirúrgicos así como cualquier otra información médica importante referente al objeto del proyecto. También se recogerán datos relativos al origen étnico del paciente.