Surveillance moléculaire individuelle des MRD pour les patients atteints de SMD après allo-SCT

Cette étude vise à développer des méthodes hautement sensibles pour la détection précoce des rechutes basées sur les mutations uniques des patients.

Dépistage des mutations En collaboration avec le Département de génétique clinique d'Uppsala, un premier dépistage des mutations sera effectué à l'aide du panel de séquençage commercial TrueSight© qui comprend 54 gènes mutés de manière récurrente dans les maladies myéloïdes. Sur la base des mutations identifiées, des amorces PCR pour toutes les mutations spécifiques au patient seront conçues. Les patients sans aucune mutation seront exclus de l'étude. Le dépistage mutationnel est effectué dès qu'un patient est identifié comme un candidat potentiel pour une allogreffe de cellules souches (SCT) et évalué pour le traitement pré-SCT le plus optimal. Le patient est inclus dans l'étude avant le prélèvement de moelle osseuse précédant le SCT. Dans le cas où un dépistage mutationnel n'a pas été effectué avant le traitement SCT pré-SCT, un dépistage mutationnel à partir de l'échantillon de la biobanque nationale de diagnostic (sang périphérique) peut être effectué.

Surveillance MRD Après la transplantation, des échantillons de sang périphérique seront prélevés une fois par mois ; et des échantillons de moelle osseuse seront prélevés au mois 1, 3, 6 après SCT, suivis d'un prélèvement tous les trois mois jusqu'à la rechute ou le décès. Les échantillons sont envoyés à Biobanking and Molecular Resource Infrastructure of Sweden (bbmri) qui extraira l'ADN et stockera les échantillons. En utilisant la méthode de PCR numérique très sensible, les chercheurs détermineront la taille des différents clones à différents moments. En plus de la biobanque d'ADN, bbmri collectera et conservera des cellules mononucléaires (MNC) congelées vitales à utiliser pour des études expérimentales.

Des analyses Statistics Landmark seront effectuées à différents moments après le SCT, en utilisant la présence de MRD comme facteur de risque inclus dans une analyse multivariée. De plus, les chercheurs calculeront la sensibilité, la spécificité et la valeur prédictive des MRD par rapport à la rechute. Pour chaque mutation spécifique, avec une fréquence suffisamment élevée dans la cohorte, les chercheurs définiront des valeurs seuils du MRD où la rechute est imminente.