Individuelles molekulares MRD-Monitoring für MDS-Patienten nach Allo-SCT

Diese Studie zielt darauf ab, hochempfindliche Methoden zur Früherkennung von Rückfällen basierend auf den einzigartigen Mutationen des Patienten zu entwickeln.

Screening von Mutationen In Zusammenarbeit mit der Abteilung für klinische Genetik, Uppsala, wird ein anfängliches Screening von Mutationen unter Verwendung des kommerziellen TrueSight©-Sequenzierungspanels durchgeführt, das 54 Gene enthält, die bei myeloischen Erkrankungen wiederholt mutiert sind. Basierend auf den identifizierten Mutationen werden PCR-Primer für alle patientenspezifischen Mutationen entworfen. Patienten ohne Mutation werden von der Studie ausgeschlossen. Das Mutationsscreening wird durchgeführt, sobald ein Patient als potenzieller Kandidat für eine allogene Stammzelltransplantation (SCT) identifiziert und für die optimale Vor-SCT-Behandlung bewertet wird. Der Patient wird vor der Knochenmarksentnahme vor der SCT in die Studie aufgenommen. Falls vor der SZT-MDS-Behandlung kein Mutationsscreening durchgeführt wurde, kann ein Mutationsscreening aus der diagnostischen Probe der nationalen Biobank (peripheres Blut) durchgeführt werden.

MRD-Überwachung Nach der Transplantation werden einmal monatlich periphere Blutproben entnommen; und Knochenmarkproben werden in Monat 1, 3, 6 nach der SCT entnommen, gefolgt von Probenentnahmen alle drei Monate bis zum Rückfall oder Tod. Die Proben werden an die Biobanking and Molecular Resource Infrastructure of Sweden (bbmri) gesendet, die DNA extrahiert und die Proben lagert. Mithilfe der hochempfindlichen Digital-PCR-Methode bestimmen die Forscher die Größe der verschiedenen Klone zu den verschiedenen Zeitpunkten. Zusätzlich zum Biobanking von DNA wird bbmri eingefrorene mononukleäre Zellen (MNCs) sammeln und vitalisieren, um sie für experimentelle Studien zu verwenden.

Statistik Landmark-Analysen werden zu verschiedenen Zeitpunkten nach der SCT durchgeführt, wobei das Vorhandensein von MRDs als Risikofaktor in einer multivariaten Analyse verwendet wird. Darüber hinaus werden die Ermittler die Sensitivität, Spezifität und den Vorhersagewert für MRDs in Bezug auf einen Rückfall berechnen. Für jede spezifische Mutation mit ausreichend hoher Häufigkeit in der Kohorte definieren die Ermittler Grenzwerte der MRD, bei denen ein Rückfall droht.