Greffe de microbiote digestif

La greffe de microbiote digestif est réalisée dans trois circonstances cliniques :

1. La colite à Clostridium difficile est responsable de 15 000 décès chaque année aux États-Unis. Le pronostic est très sévère chez les patients > 65 ans. En France, on dénombrait 1 800 décès liés à cette infection en 2014. En 2013, la greffe de microbiote fécal (ou microbiote digestif) a montré sa supériorité par rapport au traitement de référence dans les récidives de colite à C. difficile dans un essai randomisé. Notre équipe a démontré l'intérêt d'une greffe précoce dans la colite à C. difficile associée au ribotype 027. Cette souche est associée à des cas graves et à une mortalité élevée. Au vu du bénéfice majeur observé dans ces situations cliniques particulières, les investigateurs ont mis en place depuis 2013 dans la colite à C. difficile O27 puis en 2014 dans la colite sévère à C. difficile et depuis mai 2016 pour tous les patients. Plus de 100 greffes ont été réalisées dans le service divisant le risque de mortalité par 5. Les investigateurs ont également démontré l'intérêt d'une greffe fécale précoce dans les colites sévères quel que soit le ribotype impliqué. Par ailleurs, les investigateurs souhaitent évaluer notre protocole de greffe de microbiote fécal dès le premier épisode de colite à C. difficile dans l'« Unité de contagion à l'IHU de la Timone ».
2. Bactéries résistantes aux antibiotiques Dans le cas d'une colonisation digestive par des bactéries multirésistantes émergentes, la greffe fécale a prouvé son efficacité tant dans la littérature que dans notre unité.
3. Diarrhée chronique sans étiologies Enfin, et après élimination des autres étiologies, la greffe fécale peut être utilisée dans cette indication.

Le but de cette étude est d'étudier les caractéristiques des patients ayant bénéficié d'un traitement par greffe de microbiote digestif selon un protocole standardisé soit par sonde nasogastrique soit par gélules de microbiote digestif lyophilisé dans 3 indications : clostridium difficile Diarrhée, bactéries multirésistantes et diarrhée chronique inexpliquée sans altérer la prise en charge du patient par ailleurs.

200 patients (adultes) hospitalisés pour un épisode de colite à C. difficile, de bactérie multirésistante ou de diarrhée chronique sans étiologies seront recrutés pendant une période de 3 ans.

Après traitement par greffe de microbiote digestif, et après consentement signé, des données ont été recueillies lors de leur hospitalisation et suivies à 1 mois, 3 mois, 6 mois et 2 ans. Les données ont été analysées afin de déterminer les caractéristiques des patients bénéficiant d'une greffe de microbiote digestif selon un protocole standardisé.