Évaluation du métabarcodage basé sur le séquençage de nouvelle génération par rapport à la culture pour l'évaluation microbiologique de la kératite infectieuse

Les patients admis avec une kératite microbienne au département d'ophtalmologie de l'hôpital universitaire d'Aarhus sont évalués à la fois avec une culture conventionnelle sur des plaques de gélose, une culture en bouillon et un séquençage de nouvelle génération pour l'ADN ribosomal.

Seuls les patients présentant un infiltrat cornéen d'au moins 2 mm ou de 1 mm dans les 6 mm centraux de la cornée seront inclus dans l'étude.

L'échantillonnage comprend deux échantillons de l'œil sain controlatéral pour contrôler le microbiome normal du patient, évalué avec culture en bouillon et avec NGS.

À partir de l'infiltrat, les échantillons comprennent la culture sur gélose Sabouraud, gélose au chocolat et gélose au sang, la culture dans un bouillon et des échantillons pour NGS.

Au total, 100 patients seront inclus.