Wpływ eradykacji H.Pylori na mikrobiom

Obecne międzynarodowe wytyczne i eksperckie grupy robocze zachęcają do strategii „poszukiwania i leczenia” H. pylori w celu zapobiegania rakowi żołądka1, 2. Oczekuje się, że największa wydajność tego podejścia będzie w krajach o wysokiej zachorowalności na raka żołądka i wysokiej częstości występowania H. pylori infekcja .pylori. Podejście to będzie dodatkowo wspierane przez europejskie wytyczne Maastricht V (rękopis w przygotowaniu). Uzasadnieniem takiego podejścia jest to, że u 1-2% zakażonych osób rozwija się rak żołądka; Międzynarodowa Agencja Badań nad Rakiem sklasyfikowała infekcję H. pylori jako czynnik rakotwórczy klasy I3,4. Badanie przeprowadzone na wyspie Matsu, gdzie występuje wysokie ryzyko raka żołądka, sugeruje, że dzięki takiej strategii częstość występowania raka żołądka można zmniejszyć o 25%5; ograniczeniem jest jednak brak grupy kontrolnej.

Trzy ostatnie metaanalizy potwierdziły opłacalność takiego podejścia6-8; oczywiście opierają się one na ograniczonych obecnie dostępnych danych na temat potencjalnych zagrożeń związanych z zastosowaniem strategii opartej na populacji.

W krajach, które mają odnieść największe korzyści ze strategii, oznaczałoby to oferowanie leczenia eradykacyjnego większości populacji, np. na Łotwie wymagałoby to leczenia antybiotykami 79% populacji9 i zmieniłoby obecny status kraju o niskim zużyciu antybiotyków w kraj o średnim zużyciu. Może to potencjalnie skutkować niepożądanymi konsekwencjami niezwiązanymi z H. pylori.

W kraju o niskiej oporności H. pylori na klarytromycynę (takim jak Łotwa) zalecany standardowy schemat eradykacji H. pylori pierwszego rzutu składałby się z klarytromycyny w połączeniu z amoksycyliną lub metronidazolem i inhibitorem pompy protonowej; czas trwania wynosiłby co najmniej 10 dni10. Obszary o większej oporności H. pylori na klarytromycynę wymagałyby bardziej agresywnych metod leczenia, np. poprzez włączenie lewofloksacyny do schematu leczenia. Potencjalne zdarzenia niepożądane powodowane przez takie terapie dla mikrobiomu nie są wystarczająco zbadane; opinia ekspertów, którzy opracowują wytyczne, zasadniczo ogranicza się do stwierdzenia, że ​​1-2-tygodniowa jednorazowa antybiotykoterapia byłaby niewielką iw pełni odwracalną interwencją w mikrobiom, ponieważ według dostępnych statystyk w wielu krajach średnie spożycie antybiotyków wynosi jeden lub kilka zabiegów rocznie u pacjenta.

Jednak z ograniczonych dostępnych danych jasno wynika, że ​​nawet tygodniowe leczenie makrolidami (klarytromycyną, azytromycyną) zwiększa oporność S. pneumoniae opornych na makrolidy w gardle u zdrowych ochotników; różnica ta była istotna statystycznie w okresie 180 dni11.

Zatem celem tej propozycji projektu jest ocena długoterminowych skutków eradykacji H. pylori na mikrobiom przewodu pokarmowego (GIT), ocena jej wpływu na obfitość i częstość występowania genów kodujących beta-laktamazy o rozszerzonym spektrum (ESBL) oraz opracowanie kosztów skuteczny prototyp testu przesiewowego ESBL. Aby osiągnąć ten cel, w ramach tego projektu zostaną pobrane próbki kału pacjentów poddawanych terapii eradykacyjnej w dwóch punktach czasowych: przed rozpoczęciem eradykacji i rok po zakończeniu leczenia. W celu zmniejszenia liczby próbek kału, które pacjenci będą musieli pobrać oraz ujednolicenia procedury pobierania, uczestnicy powinni zbadać możliwość wykorzystania pojemników do badania kału na krew utajoną. Ponieważ nie ma jednoznacznie pozytywnych doniesień o zastosowaniu tych urządzeń w tego typu analizach w ramach niniejszego badania, uczestnicy powinni również opracować odpowiednią metodologię ekstrakcji DNA. Ponadto, stosując analizy oparte na sekwencjonowaniu nowej generacji, uczestnicy określą skład społeczności drobnoustrojów w każdej próbce, a poprzez porównanie danych z każdego punktu czasowego uczestnicy powinni być w stanie oszacować długoterminowe skutki terapii eradykacyjnej. Po tej analizie uczestnicy powinni dokonać identyfikacji repertuaru ESBL w każdej próbce, a także ocenić ich obfitość. Podobnie jak w przypadku analizy społeczności, porównanie obu punktów czasowych pozwoli na oszacowanie efektów terapii eradykacyjnej. Po pozyskaniu danych uczestnicy zlecą wykonanie prototypu testu przesiewowego ESBL, który będzie oparty na technologii mikrokulek.