Efeitos da erradicação do H.Pylori no microbioma

As diretrizes internacionais atuais e os grupos de trabalho de especialistas estão incentivando a estratégia "buscar e tratar" para H. pylori para prevenir o câncer gástrico1, 2. O maior rendimento dessa abordagem é esperado em países com alta incidência de câncer gástrico e alta prevalência de H .pylori infecção. Esta abordagem será apoiada pelas diretrizes europeias de Maastricht V (manuscrito em preparação). A justificativa para essa abordagem é que 1-2% dos indivíduos infectados estão desenvolvendo câncer gástrico; a Agência Internacional de Pesquisa sobre o Câncer classificou a infecção por H.pylori como carcinógeno Classe I3, 4. Um estudo na ilha de Matsu com alto risco de câncer gástrico sugeriu que a incidência de câncer gástrico pode ser reduzida em 25% com essa estratégia5; as limitações, no entanto, incluem a falta do grupo de controle.

Três metanálises recentes confirmaram o custo-efetividade dessa abordagem6-8; é claro, eles se baseiam nos dados limitados atualmente disponíveis sobre os riscos potenciais causados ​​pela aplicação de estratégias baseadas na população.

Nos países que se espera que mais se beneficiem da estratégia, isso significaria oferecer tratamento de erradicação para a maioria da população, por ex. na Letônia, isso exigiria tratamento com antibióticos para 79% da população9 e mudaria o status atual de um país com baixo consumo de antibióticos para um país com consumo médio. Isso poderia resultar em consequências adversas não relacionadas ao H.pylori.

Em um país com baixa resistência de H.pylori à claritromicina (como a Letônia), o regime de erradicação padrão de primeira linha recomendado para H.pylori consistiria em claritromicina em combinação com amoxicilina ou metronidazol e um inibidor da bomba de prótons; a duração seria de pelo menos 10 dias10. Áreas com maior resistência de H.pylori à claritromicina exigiriam modalidades de tratamento mais agressivas, por ex. incluindo levofloxacina ao regime. Os potenciais eventos adversos causados ​​por tais terapias ao microbioma são insuficientemente estudados; a opinião de especialistas que estão desenvolvendo diretrizes é geralmente limitada à consideração de que o tratamento antibiótico de uma a duas semanas seria uma intervenção menor e totalmente reversível no microbioma, pois, de acordo com as estatísticas disponíveis em muitos países, a taxa média de ingestão de antibióticos é de um ou vários tratamentos por ano em um indivíduo.

No entanto, a partir dos dados limitados disponíveis, há uma mensagem clara de que mesmo o tratamento de uma semana com macrólidos (claritromicina, azitromicina) aumenta a resistência de S.pneumoniae resistente a macrólidos na faringe de voluntários saudáveis; essa diferença foi estatisticamente significativa em um período de 180 dias11.

Assim, o objetivo desta proposta de projeto é avaliar os efeitos a longo prazo da erradicação do H. pylori no microbioma do trato gastrointestinal (GIT), avaliar seus efeitos na abundância e prevalência de genes codificadores de beta-lactamases de espectro estendido (ESBL) e desenvolver custos protótipo de teste de triagem ESBL eficaz. Para atingir este objetivo no âmbito deste projeto serão coletadas amostras fecais de pacientes que estão em tratamento de erradicação em dois momentos: antes do início da erradicação e um ano após o término do tratamento. A fim de diminuir o número de amostras de fezes que os pacientes terão que adquirir e padronizar o procedimento de amostragem, os participantes devem explorar a possibilidade de empregar recipientes para teste de sangue oculto nas fezes. Uma vez que não há relatórios conclusivamente positivos sobre o emprego desses dispositivos em tais análises dentro do escopo desta pesquisa, os participantes também devem desenvolver uma metodologia apropriada de extração de DNA. Além disso, empregando análises baseadas em sequenciamento de próxima geração, os participantes devem determinar a composição da comunidade microbiana em cada amostra e, por meio da comparação de dados de cada ponto de tempo, os participantes devem ser capazes de estimar os efeitos a longo prazo da terapia de erradicação. Após esta análise os participantes devem realizar a identificação do repertório ESBL dentro de cada amostra e também avaliar a abundância de suas abundâncias. Da mesma forma que no caso da análise da comunidade, a comparação de ambos os momentos permitirá estimar os efeitos da terapia de erradicação. Após a aquisição dos dados, os participantes terceirizarão a criação do protótipo do teste de triagem ESBL, que será baseado na tecnologia de emprego de microesferas.