Effetti dell'eradicazione di H.Pylori sul microbioma

Le attuali linee guida internazionali e i gruppi di lavoro di esperti stanno incoraggiando la strategia "ricerca e cura" per H.pylori per prevenire il cancro gastrico1, 2. Il massimo rendimento di questo approccio è previsto nei paesi con un'elevata incidenza di cancro gastrico e un'elevata prevalenza di H. infezione da .pylori. Questo approccio sarà ulteriormente supportato dalle linee guida europee Maastricht V (manoscritto in preparazione). La logica di questo approccio è che l'1-2% degli individui infetti sta sviluppando un cancro gastrico; l'Agenzia Internazionale per la Ricerca sul Cancro ha classificato l'infezione da H.pylori come cancerogeno di Classe I3, 4. Uno studio sull'isola di Matsu ad alto rischio di cancro gastrico ha suggerito che l'incidenza del cancro gastrico può essere ridotta del 25% con tale strategia5; le limitazioni, tuttavia, includono la mancanza del gruppo di controllo.

Tre recenti meta-analisi hanno confermato l'efficacia in termini di costi di tale approccio6-8; ovviamente, questi si basano sui dati limitati attualmente disponibili sui potenziali rischi causati dall'applicazione della strategia basata sulla popolazione.

Nei paesi che dovrebbero beneficiare maggiormente della strategia ciò significherebbe offrire un trattamento di eradicazione alla maggioranza della popolazione, ad es. in Lettonia ciò richiederebbe un trattamento antibiotico al 79% della popolazione9 e cambierebbe lo stato attuale di paese a basso consumo di antibiotici in un paese a consumo medio. Ciò potrebbe potenzialmente comportare conseguenze avverse non correlate a H.pylori.

In un paese con bassa resistenza dell'H.pylori alla claritromicina (come la Lettonia), il regime standard di eradicazione di prima linea dell'H.pylori raccomandato consisterebbe in claritromicina in combinazione con amoxicillina o metronidazolo e un inibitore della pompa protonica; la durata sarebbe di almeno 10 giorni10. Le aree con maggiore resistenza H.pylori alla claritromicina richiederebbero modalità di trattamento più aggressive, ad es. includendo la levofloxacina nel regime. I potenziali eventi avversi causati da tali terapie al microbioma non sono sufficientemente studiati; l'opinione degli esperti che stanno sviluppando le linee guida è generalmente limitata alla considerazione che il trattamento antibiotico una tantum di 1-2 settimane sarebbe un intervento minore e completamente reversibile sul microbioma poiché secondo le statistiche disponibili in molti paesi i tassi medi di assunzione di antibiotici uno o più trattamenti all'anno in un soggetto.

Tuttavia, dai dati limitati disponibili, c'è un chiaro messaggio che anche un trattamento di una settimana con macrolidi (claritromicina, azitromicina) sta aumentando la resistenza di S. pneumoniae resistente ai macrolidi nella faringe in volontari sani; questa differenza era statisticamente significativa entro un periodo di 180 giorni11.

Pertanto, lo scopo di questa proposta di progetto è valutare gli effetti a lungo termine dell'eradicazione di H.pylori sul microbioma del tratto gastrointestinale (GIT), valutarne gli effetti sull'abbondanza e la prevalenza dei geni che codificano le beta-lattamasi a spettro esteso (ESBL) e sviluppare i costi prototipo di test di screening ESBL efficace. Per raggiungere questo obiettivo nell'ambito di questo progetto verranno raccolti campioni fecali di pazienti sottoposti alla terapia di eradicazione in due momenti: prima dell'inizio dell'eradicazione e un anno dopo il trattamento finale. Al fine di ridurre il numero di campioni di feci che i pazienti devono acquisire e standardizzare la procedura di campionamento, i partecipanti dovrebbero esplorare la possibilità di utilizzare contenitori per analisi del sangue occulto fecale. Poiché non ci sono rapporti conclusivi positivi sull'impiego di questi dispositivi in ​​tali analisi nell'ambito di questa ricerca, i partecipanti dovranno anche sviluppare un'appropriata metodologia di estrazione del DNA. Inoltre, utilizzando le analisi basate sul sequenziamento di nuova generazione, i partecipanti determineranno la composizione della comunità microbica all'interno di ciascun campione e, attraverso il confronto dei dati di ciascun punto temporale, i partecipanti dovrebbero essere in grado di stimare gli effetti a lungo termine della terapia di eradicazione. Dopo questa analisi i partecipanti dovrebbero eseguire l'identificazione del repertorio ESBL all'interno di ciascun campione e anche valutare la loro abbondanza. Come nel caso dell'analisi di comunità, il confronto di entrambi i tempi consentirà di stimare gli effetti della terapia di eradicazione. Dopo l'acquisizione dei dati, i partecipanti devono esternalizzare la creazione del prototipo del test di screening ESBL, che si baserà sulla tecnologia delle microsfere occupazionali.