A H. Pylori kiirtásának hatása a mikrobiomra

A jelenlegi nemzetközi iránymutatások és szakértői munkacsoportok a H. pylori "keress és kezelj" stratégiát bátorítanak a gyomorrák megelőzésére1, 2. Ennek a megközelítésnek a legmagasabb hozama azokban az országokban várható, ahol magas a gyomorrák előfordulási gyakorisága és magas a H. prevalenciája. .pylori fertőzés. Ezt a megközelítést a Maastricht V. európai irányelvei is alátámasztják (kézirat készül). Ennek a megközelítésnek az az oka, hogy a fertőzött egyének 1-2%-ánál alakul ki gyomorrák; a Nemzetközi Rákkutató Ügynökség a H. pylori fertőzést I. osztályú rákkeltőnek minősítette3, 4. Egy Matsu-szigeten végzett, magas gyomorrákkockázatú tanulmány szerint a gyomorrák előfordulása 25%-kal csökkenthető ilyen stratégiával5; a korlátok közé tartozik azonban a kontrollcsoport hiánya.

Három közelmúltbeli metaanalízis megerősítette az ilyen megközelítés költséghatékonyságát6-8; Természetesen ezek a jelenleg rendelkezésre álló korlátozott adatokon alapulnak a populációalapú stratégiaalkalmazás által okozott lehetséges kockázatokról.

Azokban az országokban, amelyek várhatóan a legtöbb hasznot húzzák a stratégiából, ez azt jelentené, hogy a lakosság többségének fel kell ajánlani a felszámolási kezelést, pl. Lettországban ez a lakosság 79%-ának9 igényelne antibiotikumos kezelést, és az alacsony antibiotikum-fogyasztású ország jelenlegi státuszát átlagos fogyasztó országgá változtatná. Ez potenciálisan a H. pyloritól független káros következményekkel járhat.

Egy olyan országban, ahol alacsony a H. pylori-rezisztencia a klaritromicinnel szemben (például Lettország), az ajánlott H. pylori 1. vonalbeli standard eradikációs rendszer klaritromicint amoxicillinnel vagy metronidazollal kombinálva, valamint protonpumpa-gátlót tartalmazna; az időtartam legalább 10 nap10. A klaritromicinnel szemben magasabb H. pylori rezisztenciájú területeken agresszívabb kezelési módokra lenne szükség, pl. levofloxacint a kezelési rendbe. Az ilyen terápiák által a mikrobiomnak okozott lehetséges nemkívánatos eseményeket nem vizsgálták kellőképpen; az irányelveket kidolgozó szakértői vélemény általában arra korlátozódik, hogy az 1-2 hetes egyszeri antibiotikum kezelés csekély és teljesen visszafordítható beavatkozás lenne a mikrobiomra, mivel a rendelkezésre álló statisztikák szerint sok országban az átlagos antibiotikum bevitel egy vagy több kezelések évente egy alanyban.

A rendelkezésre álló korlátozott adatok alapján azonban egyértelmű üzenetünk van arra, hogy már az egyhetes makrolid-kezelés (klaritromicin, azitromicin) is növeli a makrolid-rezisztens S.pneumoniae rezisztenciáját a garatban egészséges önkéntesekben; ez a különbség statisztikailag szignifikáns volt 180 napon belül11.

Így ennek a projektjavaslatnak az a célja, hogy értékelje a H. pylori eradikációnak a gyomor-bél traktus (GIT) mikrobiómára gyakorolt ​​hosszú távú hatásait, értékelje a kiterjesztett spektrumú béta-laktamázokat (ESBL) kódoló gének abundanciájára és prevalenciájára gyakorolt ​​hatását, és meghatározza a költségeket. hatékony ESBL szűrővizsgálati prototípus. E cél elérése érdekében a projekt keretein belül az eradikációs terápia alatt álló betegek székletmintáját két időpontban gyűjtik: az eradikáció megkezdése előtt és egy évvel a végső kezelés után. A betegeknek beszerezendő székletminták számának csökkentése és a mintavételi eljárás szabványosítása érdekében a résztvevőknek meg kell vizsgálniuk az okkult ürülékvér vizsgálati edények alkalmazásának lehetőségét. Mivel nincsenek egyértelműen pozitív jelentések ezen eszközök ilyen elemzésekben való alkalmazásáról a jelen kutatás keretein belül, a résztvevőknek megfelelő DNS-kivonási módszertant is ki kell dolgozniuk. Továbbá a következő generációs szekvenáláson alapuló elemzések alkalmazásával a résztvevőknek meg kell határozniuk a mikrobiális közösség összetételét minden egyes mintán belül, és az egyes időpontokból származó adatok összehasonlításával a résztvevőknek képesnek kell lenniük megbecsülni az eradikációs terápia hosszú távú hatásait. Ezt az elemzést követően a résztvevőknek el kell végezniük az ESBL repertoár azonosítását az egyes mintákon belül, és értékelniük kell abundanciájukat is. A közösségi elemzéshez hasonlóan a két időpont összehasonlítása lehetővé teszi az eradikációs terápia hatásainak becslését. Az adatok beszerzését követően a résztvevőknek ki kell szervezniük az ESBL szűrővizsgálati prototípus elkészítését, amely foglalkoztatási mikrogyöngy technológián alapul.