Effekter av H.Pylori-utryddelse på mikrobiom

De gjeldende internasjonale retningslinjene og ekspertarbeidsgruppene oppmuntrer til "søk-og-behandle"-strategi for H.pylori for å forhindre magekreft1, 2. Det høyeste utbyttet av denne tilnærmingen forventes i land med høy forekomst av magekreft og høy forekomst av H. .pylori-infeksjon. Denne tilnærmingen vil bli ytterligere støttet av Maastricht V europeiske retningslinjer (manuskript under forberedelse). Begrunnelsen for denne tilnærmingen er at 1-2 % av de infiserte individene utvikler magekreft; Det internasjonale byrået for kreftforskning har klassifisert H.pylori-infeksjon som kreftfremkallende klasse I3, 4. En studie på øya Matsu med høy risiko for magekreft har antydet at forekomsten av magekreft kan reduseres med 25 % ved en slik strategi5; begrensningene inkluderer imidlertid mangel på kontrollgruppen.

Tre nyere metaanalyser har bekreftet kostnadseffektiviteten til en slik tilnærming6-8; de er selvfølgelig basert på de begrensede tilgjengelige dataene om potensielle risikoer forårsaket av populasjonsbasert strategianvendelse.

I de landene som forventes å ha størst nytte av strategien vil dette bety å tilby utryddelsesbehandling til flertallet av befolkningen, f.eks. i Latvia vil dette kreve antibiotikabehandling til 79 % av befolkningen9, og vil endre den nåværende statusen som et land med lavt antibiotikaforbruk til et land med gjennomsnittlig forbruk. Dette kan potensielt resultere i uheldige konsekvenser som ikke er relatert til H.pylori.

I et land med lav H.pylori-resistens mot klaritromycin (som Latvia), vil det anbefalte H.pylori 1st-line standard eradikeringsregimet bestå av klaritromycin i kombinasjon med enten amoxicillin eller metronidazol, og en protonpumpehemmer; varigheten vil være minst 10 dager10. Områder med høyere H.pylori-resistens mot klaritromycin vil kreve mer aggressive behandlingsmodaliteter, f.eks. ved å inkludere levofloxacin i kuren. De potensielle uønskede hendelsene forårsaket av slike terapier for mikrobiom er utilstrekkelig studert; ekspertuttalelsen som utvikler retningslinjer er generelt begrenset til hensynet til at 1-2 ukers engangs antibiotikabehandling vil være en mindre og fullt reversibel intervensjon på mikrobiom siden i henhold til tilgjengelig statistikk i mange land er gjennomsnittlig antibiotikainntak én eller flere. behandlinger per år i et fag.

Men fra de begrensede tilgjengelige dataene er det en klar melding om at selv én ukes behandling med makrolider (klaritromycin, azitromycin) øker motstanden av makrolidresistente S.pneumoniae i svelget hos friske frivillige; denne forskjellen var statistisk signifikant innen en periode på 180 dager11.

Målet med dette prosjektforslaget er derfor å evaluere de langsiktige effektene av utryddelse av H.pylori på mikrobiom i mage-tarmkanalen (GIT), å evaluere dens effekter på overflod og prevalens av utvidede spektrum beta-laktamaser (ESBL) kodende gener og utvikle kostnader. effektiv ESBL screening test prototype. For å nå dette målet innen rammen av dette prosjektet vil det bli samlet inn fekale prøver av pasienter som gjennomgår eradikeringsterapien på to tidspunkter: før utryddelsestart og ett år etter siste behandling. For å redusere antallet avføringsprøver som pasienter må skaffe og standardisere prøvetakingsprosedyren, bør deltakerne undersøke muligheten for å bruke avføringsbeholdere for okkulte blodprøver. Siden det ikke er noen avgjørende positive rapporter om bruk av disse enhetene i slike analyser innenfor rammen av denne forskningen, skal deltakerne også utvikle en passende DNA-ekstraksjonsmetodikk. Videre skal deltakerne ved å bruke neste generasjons sekvenseringsbaserte analyser bestemme den mikrobielle fellesskapssammensetningen i hver prøve, og gjennom sammenligning av data fra hvert tidspunkt skal deltakerne være i stand til å estimere langtidseffektene av utryddelsesterapi. Etter denne analysen bør deltakerne utføre identifiseringen av ESBL-repertoaret i hver prøve og også evaluere overfloden deres. På samme måte som ved samfunnsanalyse skal sammenligningen av begge tidspunkt gjøre det mulig å estimere effekten av eradikasjonsterapi. Etter innhenting av dataene skal deltakerne sette ut etableringen av ESBL screeningtestprototype, som skal være basert på sysselsettingsmikroperleteknologi.