Effekter af H.Pylori-udryddelse på mikrobiom

De nuværende internationale retningslinjer og ekspertarbejdsgrupper tilskynder til "search-and-treat"-strategi for H.pylori til forebyggelse af gastrisk cancer1, 2. Det højeste udbytte af denne tilgang forventes i lande med høj forekomst af mavekræft og høj forekomst af H. .pylori-infektion. Denne tilgang vil blive yderligere understøttet af Maastricht V europæiske retningslinjer (manuskript under udarbejdelse). Begrundelsen for denne tilgang er, at 1-2% af de inficerede individer udvikler mavekræft; Det Internationale Agentur for Kræftforskning har klassificeret H.pylori-infektion som Klasse I-kræftfremkaldende3, 4. En undersøgelse på Matsu-øen med høj risiko for mavekræft har antydet, at forekomsten af ​​mavekræft kan reduceres med 25 % ved en sådan strategi5; begrænsningerne omfatter dog mangel på kontrolgruppen.

Tre nyere metaanalyser har bekræftet omkostningseffektiviteten af ​​en sådan tilgang6-8; de er naturligvis baseret på de begrænsede aktuelt tilgængelige data om potentielle risici forårsaget af befolkningsbaseret strategianvendelse.

I de lande, som forventes at få størst gavn af strategien, vil dette betyde, at der tilbydes udryddelsesbehandling til størstedelen af ​​befolkningen, f.eks. i Letland ville dette kræve antibiotikabehandling til 79 % af befolkningen9 og ville ændre den nuværende status for et land med lavt antibiotikaforbrug til et land med gennemsnitligt forbrug. Dette kan potentielt resultere i negative konsekvenser, der ikke er relateret til H.pylori.

I et land med lav H.pylori-resistens over for clarithromycin (såsom Letland) vil den anbefalede H.pylori 1st-line standard udryddelsesplan bestå af clarithromycin i kombination med enten amoxicillin eller metronidazol og en protonpumpehæmmer; varigheden ville være mindst 10 dage10. Områder med højere H.pylori-resistens over for clarithromycin ville kræve mere aggressive behandlingsmodaliteter, f.eks. ved at inkludere levofloxacin i kuren. De potentielle bivirkninger forårsaget af sådanne terapier for mikrobiom er utilstrækkeligt undersøgt; den ekspertudtalelse, der er ved at udvikle retningslinjer, er generelt begrænset til den betragtning, at 1-2 ugers engangs antibiotikabehandling ville være et mindre og fuldt reversibelt indgreb på mikrobiom, da ifølge den tilgængelige statistik i mange lande er det gennemsnitlige antibiotikaindtag en eller flere behandlinger om året i et fag.

Men ud fra de begrænsede tilgængelige data er der et klart budskab om, at selv en uges behandling med makrolider (clarithromycin, azithromycin) øger resistensen af ​​makrolidresistente S.pneumoniae i svælget hos raske frivillige; denne forskel var statistisk signifikant inden for en periode på 180 dage11.

Formålet med dette projektforslag er således at evaluere de langsigtede virkninger af udryddelse af H.pylori på mikrobiom i mave-tarmkanalen (GIT), evaluere dets virkninger på overflod og forekomst af udvidede spektrum beta-lactamaser (ESBL) kodende gener og udvikle omkostninger effektiv ESBL screeningstest prototype. For at nå dette mål inden for rammerne af dette projekt vil der blive indsamlet fækale prøver af patienter, som gennemgår udryddelsesterapien på to tidspunkter: før udryddelse påbegyndes og et år efter den endelige behandling. For at reducere antallet af fæcesprøver, som patienter skal have for at erhverve og standardisere prøvetagningsproceduren, bør deltagerne undersøge muligheden for at anvende beholdere til fækal okkult blodprøve. Da der ikke er nogen endeligt positive rapporter om anvendelse af disse anordninger i sådanne analyser inden for rammerne af denne forskning, skal deltagerne også udvikle en passende DNA-ekstraktionsmetodologi. Ved at anvende næste generations sekventeringsbaserede analyser skal deltagerne endvidere bestemme den mikrobielle samfundssammensætning inden for hver prøve, og gennem sammenligning af data fra hvert tidspunkt skal deltagerne være i stand til at estimere langtidseffekterne af udryddelsesterapi. Efter denne analyse skal deltagerne udføre identifikation af ESBL-repertoire inden for hver prøve og også evaluere deres overflod. Ligesom i tilfælde af samfundsanalyse skal sammenligningen af ​​begge tidspunkter gøre det muligt at estimere virkningerne af udryddelsesterapi. Efter erhvervelsen af ​​dataene skal deltagerne outsource oprettelsen af ​​ESBL-screeningtestprototypen, som skal være baseret på beskæftigelsesmikroperleteknologi.