Effekter av H.Pylori-utrotning på mikrobiom

De nuvarande internationella riktlinjerna och expertarbetsgrupperna uppmuntrar "sök-och-behandla"-strategi för H.pylori för att förebygga magcancer1, 2. Den högsta avkastningen av detta tillvägagångssätt förväntas i länder med hög incidens av magcancer och hög förekomst av H. .pylori-infektion. Detta tillvägagångssätt kommer att stödjas ytterligare av Maastricht V europeiska riktlinjer (manuskript under förberedelse). Skälet för detta tillvägagångssätt är att 1-2 % av de infekterade individerna utvecklar magcancer; Internationella byrån för cancerforskning har klassificerat H.pylori-infektion som cancerframkallande klass I3, 4. En studie på ön Matsu med hög risk för magcancer har föreslagit att incidensen av magcancer kan minskas med 25 % genom en sådan strategi5; begränsningarna inkluderar dock bristen på kontrollgruppen.

Tre nyare metaanalyser har bekräftat kostnadseffektiviteten hos ett sådant tillvägagångssätt6-8; Naturligtvis är de baserade på de begränsade för närvarande tillgängliga uppgifterna om potentiella risker orsakade av befolkningsbaserad strategitillämpning.

I de länder som förväntas dra mest nytta av strategin skulle detta innebära att man erbjuds utrotningsbehandling till majoriteten av befolkningen, t.ex. i Lettland skulle detta kräva antibiotikabehandling till 79 % av befolkningen9 och skulle ändra den nuvarande statusen för ett land med låg antibiotikakonsumtion till ett land med genomsnittlig konsumtion. Detta kan potentiellt resultera i negativa konsekvenser som inte är relaterade till H.pylori.

I ett land med låg H.pylori-resistens mot klaritromycin (som Lettland) skulle den rekommenderade H.pylori 1:a linjens standardutrotningsregimen bestå av klaritromycin i kombination med antingen amoxicillin eller metronidazol, och en protonpumpshämmare; varaktigheten skulle vara minst 10 dagar10. Områden med högre H.pylori-resistens mot klaritromycin skulle kräva mer aggressiva behandlingsmetoder, t.ex. genom att inkludera levofloxacin i behandlingen. De potentiella biverkningar som sådana terapier orsakar för mikrobiom är otillräckligt studerade; expertutlåtandet som håller på att utveckla riktlinjer är generellt begränsat till övervägandet att 1-2 veckors engångsantibiotikabehandling skulle vara ett mindre och helt reversibelt ingrepp på mikrobiom, eftersom enligt tillgänglig statistik i många länder är det genomsnittliga antibiotikaintaget ett eller flera behandlingar per år i ett ämne.

Men från de begränsade tillgängliga data finns det ett tydligt budskap att även en veckas behandling med makrolider (klaritromycin, azitromycin) ökar resistensen för makrolidresistenta S.pneumoniae i svalget hos friska frivilliga; denna skillnad var statistiskt signifikant inom en period av 180 dagar11.

Därför är syftet med detta projektförslag att utvärdera de långsiktiga effekterna av utrotning av H.pylori på mikrobiomet i mag-tarmkanalen (GIT), utvärdera dess effekter på förekomst och förekomst av gener som kodar för utökat spektrum av beta-laktamaser (ESBL) och utveckla kostnader. effektiv ESBL screeningtestprototyp. För att nå detta mål inom ramen för detta projekt kommer fekala prover att samlas in från patienter som genomgår eradikeringsterapin vid två tidpunkter: före utrotningens start och ett år efter den sista behandlingen. För att minska antalet avföringsprover som patienter måste skaffa och standardisera provtagningsproceduren, bör deltagarna undersöka möjligheten att använda behållare för avföringsprov för ockult blod. Eftersom det inte finns några entydigt positiva rapporter om användning av dessa anordningar i sådana analyser inom ramen för denna forskning ska deltagarna också utveckla en lämplig DNA-extraktionsmetod. Vidare ska deltagarna genom att använda nästa generations sekvenseringsbaserade analyser bestämma den mikrobiella gemenskapssammansättningen inom varje prov och genom jämförelse av data från varje tidpunkt ska deltagarna kunna uppskatta de långsiktiga effekterna av utrotningsterapi. Efter denna analys bör deltagarna utföra identifiering av ESBL-repertoar inom varje prov och även utvärdera deras överflöd. På samma sätt som i fallet med samhällsanalyser ska jämförelsen av båda tidpunkterna göra det möjligt att uppskatta effekterna av utrotningsterapi. Efter inhämtningen av data ska deltagarna lägga ut skapandet av ESBL screeningtestprototyp på entreprenad, som ska baseras på sysselsättningsmikro-pärlteknologi.