Techniki PCR suszonej plwociny przy użyciu karty Spotcard

Badania molekularne mutacji w genach M. tuberculosis związanych z opornością na leki przeciwgruźlicze (TB) są już częścią standardowej laboratoryjnej diagnostyki gruźlicy.

Implikuje to wcześniejszą wiedzę o możliwej oporności, a tym samym zapobiega niepotrzebnemu leczeniu i możliwości niepowodzenia leczenia lub toksyczności związanej z leczeniem.

Molekularna diagnostyka laboratoryjna jest szeroko rozpowszechniona w krajach o wysokich dochodach i niskiej endemicznej gruźlicy. Jednak krajom o niskich dochodach brakuje powszechnych możliwości testowania podatności, zarówno genotypowej, jak i fenotypowej. Przeprowadzanie diagnostyki molekularnej plwociny pobranej za pomocą karty punktowej mogłoby poprawić dostępność badań molekularnych.

Niniejsze badanie sprawdza, czy plwocina zebrana i umieszczona na kartach punktowych może być wykorzystana do wielu testów molekularnych w celu wykrycia, identyfikacji i przewidywania wrażliwości na gruźlicę. Oznacza to, że ekstrakcja DNA z plwociny z karty punktowej powinna być wykonalna.

Badanie jest badaniem pilotażowym z udziałem dorosłych pacjentów oddziału gruźlicy Uniwersyteckiego Centrum Medycznego Groningen (UMCG) Beatrixoord, Haren. Wytworzona plwocina zostanie zebrana, wysuszona na kartach punktowych, a ekstrakcja DNA z karty zostanie przetestowana. Jeśli wykrywanie molekularne jest pozytywne dla bakterii gruźlicy, zostaną przeprowadzone dodatkowe testy. Na podstawie obecnych/nieobecnych mutacji w genach związanych z podatnością na oporność można przewidzieć, że zostaną przeprowadzone różne techniki molekularne w celu zidentyfikowania możliwych mutacji. Ponadto plwocina będzie pobierana w miarę jej wytwarzania przez pacjentów. Próbki plwociny z niskim obciążeniem bakteryjnym mogą być również testowane i mogą testować czułość procedury.

Na koniec zostaną przetestowane techniki, takie jak wykrywanie RNA, aby zidentyfikować obciążenie bakteryjne. Można to zrobić, jeśli pobrano więcej niż jedną próbkę od pacjentów.

Badani zostaną wybrani na podstawie wieku, uczestnictwa w standardowym TDM i zażywania narkotyków. Analizie poddane zostaną parametry demograficzne. Próbki plwociny będą pobierane dwa razy w tygodniu (we wtorek i piątek).