PCR techniky sušeného sputa pomocí Spotcard

Molekulární testování mutací v genech M. tuberculosis spojených s rezistencí k antituberculosis (TB) lékům je již součástí standardní laboratorní diagnostiky TBC.

To implikuje dřívější znalost možné rezistence, a tak zabraňuje zbytečné léčbě a možnosti selhání léčby nebo toxicity související s léčbou.

Molekulární laboratorní diagnostika je široce rozšířena v endemických zemích s vysokými příjmy a nízkou úrovní TBC. V zemích s nízkými příjmy však chybí rozšířená zařízení pro testování citlivosti, ať už genotypové nebo fenotypové. Provádění molekulární diagnostiky sputa odebraného pomocí spotové karty by mohlo zlepšit dostupnost molekulárního testování.

Tato studie zkoumá, zda by sputum odebrané a umístěné na spotové karty mohlo být použito pro více molekulárních testů pro detekci, identifikaci a predikci citlivosti TBC. To znamená, že by měla být proveditelná extrakce DNA sputa ze spotové karty.

Studie je pilotní studií s dospělými pacienty z oddělení tuberkulózy University Medical Center Groningen (UMCG) Beatrixoord, Haren jako subjekty. Vytvořené sputum bude odebráno, vysušeno na spotových kartách a bude testována extrakce DNA z karty. Pokud je molekulární detekce pozitivní na bakterie tuberkulózy, provedou se další testy. Na základě přítomnosti/nepřítomnosti mutací v genech spojených s rezistencí lze predikovat citlivost, budou provedeny různé molekulární techniky k identifikaci možných mutací. Kromě toho bude sputum odebíráno tak, jak ho pacienti produkují. Vzorky sputa s nízkou bakteriální zátěží mohou být také testovány a mohou testovat citlivost postupu.

Nakonec budou testovány techniky jako detekce RNA k identifikaci bakteriální zátěže. To lze provést, pokud byl odebrán více než jeden vzorek pacientů.

Subjekty budou vybírány podle věku, účasti ve standardním TDM a užívání drog. Budou analyzovány demografické parametry. Vzorky sputa budou odebírány dvakrát týdně (v úterý a pátek).