PCR-teknikker til tørret sputum ved hjælp af et spotcard

Molekylær testning for mutationer i M. tuberculosis-gener forbundet med resistens af anti-tuberkulose (TB) lægemidler er allerede en del af standard laboratorie-TB-diagnostik.

Dette implicerer tidligere viden om mulig resistens og forhindrer dermed unødvendig behandling og risikoen for behandlingssvigt eller behandlingsrelateret toksicitet.

Den molekylære laboratoriediagnostik er vidt udbredt i lande med høj indkomst og lav TB. Imidlertid mangler lavindkomstlandene udbredte faciliteter til at teste for modtagelighed, enten genotypisk eller fænotypisk. Udførelse af molekylær diagnostik på sputum indsamlet med et spotkort kan forbedre tilgængeligheden til molekylær testning.

Denne undersøgelse undersøger, om sputum indsamlet og sat på spot-kort kan bruges til flere molekylære tests til påvisning, identifikation og modtagelighedsforudsigelse af TB. Det betyder, at DNA-ekstraktion af sputum fra spotkortet bør være mulig.

Undersøgelsen er et pilotstudie med voksne patienter fra tuberkuloseafdelingen ved University Medical Center Groningen (UMCG) Beatrixoord, Haren som forsøgspersoner. Det producerede sputum vil blive opsamlet, tørret på spotkort, og DNA-ekstraktion fra kortet vil blive testet. Hvis molekylær detektion er positiv for tuberkulosebakterien, vil der blive udført yderligere tests. Baseret på tilstedeværelsen/fraværet af mutationer i generne forbundet med resistensmodtagelighed kan forudsættes, vil forskellige molekylære teknikker blive udført for at identificere mulige mutationer. Ydermere vil der blive opsamlet sputum, efterhånden som patienterne producerer det. Sputumprøver med lav bakteriemængde kan også testes og kan teste procedurens følsomhed.

Til sidst vil teknikker som RNA-detektion blive testet for at identificere bakteriebelastningen. Dette kan gøres, hvis mere end én prøve af patienter blev indsamlet.

Emner vil blive udvalgt på alder, deltagelse i standard TDM og stofbrug. Demografiske parametre vil blive analyseret. Sputumprøver vil blive taget to gange om ugen (på tirsdag og fredag).