Pesquisa de fatores genéticos envolvidos na luxação congênita do quadril: estudo de associação de todo o genoma no Grand West France (GENETHIP)

A luxação congênita do quadril (DCC) é uma das anormalidades esqueléticas mais frequentes na população caucasiana (incidência: 2-10/1.000). Esta doença resulta de uma anormalidade das relações da cabeça femoral com o acetábulo, gerada por um defeito morfológico da cavidade e/ou hipermobilidade articular.

Esta condição é agora definida como uma doença multifatorial envolvendo, por um lado, fatores mecânicos relacionados às condições de gravidez e parto e, por outro lado, fatores genéticos sugeridos pela predisposição étnica e agregação familiar observada. Apesar da triagem neonatal, a DCC continua sendo um problema de saúde pública pela sua alta frequência, pelo prejuízo funcional que acarreta em caso de diagnóstico tardio e pela evolução natural para coxartrose.

A DCC foi objeto de um número significativo de publicações sobre os aspectos difíceis de seu rastreamento e tratamento, mas, no momento, poucos dados estão disponíveis sobre os fatores genéticos envolvidos.

Os estudos genéticos conduzidos na DCC basearam-se em estudos de associações de caso-controle, focados em genes candidatos, e análise de ligação genética, duas estratégias classicamente utilizadas em epidemiologia genética.

Até o momento, essas estratégias não permitiram elucidar o determinismo genético da patologia.

Os consideráveis ​​progressos realizados nos últimos anos, tanto no campo do conhecimento do genoma humano e da sua variabilidade, como no desenvolvimento de ferramentas metodológicas e tecnológicas, permitem compreender melhor o determinismo genético de doenças complexas como a DCC.

O desenvolvimento das técnicas de sequenciação de banda larga, dita sequenciação de nova geração (NGS for Next Generation Sequencing) torna de facto acessível a sequenciação de todo o genoma ou do conjunto das suas regiões codificantes (exoma) e permite agora identificar variantes raras, ou seja digamos variantes com uma frequência de alelos menores de menos de 1%. Essas variantes anteriormente não eram reconhecíveis pelas estratégias tradicionalmente usadas em epidemiologia genética, que se baseiam no estudo de variantes comuns (frequência alélica menor de ≥ 5%) listadas nos bancos de dados públicos do genoma humano .

A técnica de sequenciação NGS permite abordar o problema do estudo de doenças complexas sob uma nova luz e parece necessário aplicar esta estratégia à CHD para procurar fatores genéticos envolvidos na patologia.

A estratégia de análise genética inicialmente prevista consistia em um estudo de associação ampla do genoma (GWAS), que visa genotipar milhões de marcadores genéticos frequentes espalhados ao longo do genoma e testar sua associação com a doença.

Os avanços tecnológicos no campo da genética molecular desde a implementação do protocolo GENETHIP permitiram vislumbrar novas estratégias para identificar os fatores genéticos envolvidos em uma doença complexa como a DCC. Essas estratégias incluem o sequenciamento de alto rendimento - Next Generation Sequencing (NGS) - que agora possibilita o sequenciamento de todas as regiões codificadoras do genoma (exoma). Para além das variantes frequentes, esta técnica permite ainda identificar variantes raras (frequência do alelo menor <1%), não analisadas pela estratégia inicialmente prevista neste projeto.

Decidiu-se, portanto, adotar esta nova estratégia no estudo GENETHIP. O tamanho da amostra poderia ser reduzido, pois a frequência média do alelo menor é menor com esse tipo de estudo.

A nova estratégia genética adotada exige, no entanto, a inclusão de fenótipos selecionados, o que leva a recrutar exclusivamente pacientes com história familiar de distúrbios congênitos do quadril e excluir aqueles que tiveram apresentação pelo assento (principal fator de risco mecânico da DCC). Com isso, pretende-se direcionar melhor o caráter genético da patologia.