Studie för detektion av donatorhärlett cellfritt DNA efter njurtransplantation med hjälp av Devysers NGS-baserad chimerismanalys.

Varje år genomgår 40-60 patienter njurtransplantation med en levande donator (LD) på Karolinska Universitetssjukhuset. Före transplantation undersöks dessa patienter och deras donatorer för deras immunologiska kompatibilitet. Detta inkluderar cytotoxiska och flödescytometriska korsmatchningar, HLA-typning samt bestämning av eventuell närvaro av panelreaktiva HLA-antikroppar (PRA). Normalt utförs dessa undersökningar 2-3 månader före njurtransplantation. När en patient har accepterats för transplantation med en given levande donator kommer de före transplantationen att tillfrågas om de är intresserade av att ta del av denna studie. Om patienten och givaren accepterar kommer vi att samla in 15 mL blod före transplantationen med hjälp av lämpliga provtagningsrör (cellfria BCT-rör). Detta prov kommer att användas för screening av patient och donator för specifika genetiska markörer. Dessutom kommer proverna före transplantation att användas för att bestämma närvaron eller frånvaron av HLA-antikroppar för varje patient. Vi siktar på att inkludera upp till 50 patienter i den aktuella studien.

Under de första 24-48 timmarna efter transplantationen kommer ytterligare två prover (10 ml) från patienten att samlas in för att mäta den potentiella närvaron av dd-cfDNA inklusive cellfria partiklar som exosomer. Det cellfria DNA och RNA från alla prover kommer att extraheras, lagras frysta och sekvenseras senare. Efter transplantation och påbörjad immunsuppressiv terapi kommer prover för analys att tas en gång i veckan i upp till 3 månader. Alla insamlade prover kommer antingen att analyseras omedelbart eller frysas för framtida analys. Förvarade frysta prover kan vid en senare tidpunkt tinas, satsas och analyseras med hjälp av molekylära tekniker inklusive sekvensering för mätning av dd-cfDNA eller analys av förekomsten av HLA-antikroppar med användning av kommersiella pärlteknologier (Luminex eller Immucor). Resultat från dessa analyser kommer att läggas till en särskild databas. De erhållna laboratorieresultaten kommer att jämföras med kliniska resultat inklusive transplantatöverlevnad, patientöverlevnad, kliniska och subkliniska avstötningar etc. samt andra laboratoriedata (t.ex. resultat från patologisk undersökning av transplantatet, klinisk kemi, koncentration av immunsuppressiva läkemedel etc).