Změny biomarkerů z krve v průběhu času u pacientů s adenokarcinomem pankreatu

Toto je jednorázová prospektivní studie v nemocnici Johns Hopkins Hospital, která bude probíhat od 1. ledna 2015 do 31. prosince 2018. Všichni pacienti, kteří se dostaví do nemocnice Johns Hopkins s adenokarcinomem pankreatu (PDAC) za účelem vyhodnocení léčby chemoterapií, radiační terapií a/nebo chirurgickým zákrokem, budou osloveni k účasti v této studii, ale budou zahrnuti pouze ti, kteří souhlasí se studií. . Všem pacientům, kteří souhlasí s účastí v této studii, bude odebrána krev (přibližně 50 ml nebo 3–4 polévkové lžíce) v době diagnózy, ale před podáním jakékoli léčby. Po jakékoli léčbě bude odebrána další krev. Například těm pacientům, kteří podstoupí chirurgickou resekci, bude také odebrána krev po resekci před propuštěním. Těm pacientům, kteří podstoupí léčbu chemoterapií, radiační terapií nebo biologickou/vakcínovou terapií, bude po dokončení této léčby jednou odebrána krev. Pokud pacient podstoupí chemoterapii a poté chirurgickou resekci, bude mu odebrána krev po chemoterapii, ale před chirurgickou resekcí a poté znovu po chirurgické resekci, to vše navíc k odběru krve před léčbou (viz schéma zahrnuté v IRB). První 2 roky po operaci budou vzorky odebírány každé 3-4 měsíce. Kromě toho budou vyšetřovatelé sbírat vzorky každých 6 měsíců po dobu následujících dvou let. U všech pacientů, u kterých se zjistí, že jsou naživu a bez onemocnění déle než 4 roky po operaci, budou vzorky odebírány jednou ročně. Tato krev bude uložena ve výzkumném zařízení vyšetřovatelů a jako taková bude označena deidentifikovatelným kódem. Pokud pacient kdykoli během studie odmítne další odběry krve nebo ztratí kontrolu, odebrané vzorky budou stále použity.

Krev bude zpracována v den odběru, do 6 hodin od odběru. Dvacet (20) ml krve odebrané do dvou zkumavek s fialovým uzávěrem bude použito k izolaci cirkulujících nádorových buněk (CTC) pomocí testu Isolation by Size of Epithelial Tumor Cells (ISET), který odděluje nádorové buňky podle velikosti na membránu. které lze použít pro další experimenty. Těchto 20 ml krve bude smícháno s ISET pufrem podle standardního protokolu a přefiltrováno přes ISET přístroj na membrány. Tyto membrány budou skladovány při -20 °C pod neidentifikovatelným číslem a zůstanou za těchto podmínek několik let s plnou konzervací buněk. Na těchto membránách budou provedeny další experimenty, které zahrnují imunofluorescenční barvení, laserovou záchytnou mikroskopii a genetickou analýzu. Zbývajících 30 ml krve odebrané do zkumavek s červeným a fialovým uzávěrem bude zpracováno standardním protokolem do 6 hodin od odběru. Krev se dvakrát odstředí, aby se odstranily bílé krvinky a plazma, a zmrazí se. Mutace řídícího genu charakterizované v resekovaných nádorech budou monitorovány digitální kapénkovou polymerázovou řetězovou reakcí (ddPCR), včetně homologu virového onkogenu sarkomu potkana Kirsten (k-ras), p53, p16/cdkn2a a genu Deleted in Pancreatic Cancer-4 ( DPC4/SMAD4) k identifikaci přítomnosti ctDNA a zda hladiny stoupají.

Data budou shromažďována, deidentifikována a analyzována jako jediný soubor dat v nemocnici Johns Hopkins Hospital. Data budou získávána z elektronických a papírových klinických tabulek pacientů z nemocnice John Hopkins Hospital počínaje 1. 1. 2015, přičemž k 1. 1. 2015 budou shromažďována pouze data. Konkrétněji budou přezkoumány radiologické, chemoterapeutické, operativní a patologické zprávy, souhrny propuštění a klinické poznámky a shromážděny údaje z těchto zdrojů. U pacientů ztracených ve sledování bude prohledán index úmrtí v sociálním zabezpečení (ale nebude nutné shromažďovat čísla sociálního zabezpečení), aby byly nalezeny důkazy o úmrtí. Shromážděné údaje o pacientech budou vloženy do vyhrazené databáze. Údaje budou shromažďovány pouze za účelem korelace výsledků a charakteristik nádoru s biomarkery identifikovanými během této studie. Po nashromáždění dat a před analýzou budou všechny osobní identifikátory vymazány a v době statistické analýzy nebudou přítomny žádné identifikovatelné informace. Vygenerovaná data subjektu se neobjeví v lékařském záznamu subjektu a budou použita pouze pro výzkumné účely. Údaje budou zaznamenány v heslem chráněné, zabezpečené databázi v kanceláři hlavního zkoušejícího a budou přístupné pouze klíčovému personálu. Po shromáždění všech údajů o konkrétním subjektu bude identita subjektu vymazána, aby byla zajištěna důvěrnost.

Údaje shromážděné v této studii nebudou použity pro klinickou péči o žádného pacienta ve studii.

Kritéria zahrnutí/vyloučení

Vyšetřovatelé budou zahrnovat všechny pacienty, kteří se dostaví do nemocnice Johns Hopkins k léčbě s diagnózou adenokarcinomu slinivky břišní. Subjekty budou zařazeny pouze v případě, že jsou starší 18 let a plánují podstoupit léčbu v nemocnici Johnse Hopkinse. Všichni pacienti s neprimárními tumory pankreatu, pankreatickými neuroendokrinními tumory nebo benigními pankreatickými masami budou vyloučeni. Pacienti budou vyloučeni, pokud již podstoupili jakoukoli léčbu v jiném ústavu.

Cílem výzkumných pracovníků je zahrnout data od nejméně 200 pacientů během tří let této studie. Primárním výstupem bude identifikace biomarkerů v krvi pacientů s adenokarcinomem pankreatu a změny těchto biomarkerů v čase ve vztahu k léčbě. Tyto biomarkery budou zahrnovat specifické protilátky, cirkulující nádorové buňky (CTC) a cirkulující nádorovou DNA (ctDNA). Sekundární výsledky budou zahrnovat vztah hladin biomarkerů před léčbou nebo změn v hladinách biomarkerů k přežití bez onemocnění a celkovému přežití, riziku metastáz, recidivě onemocnění a odpovědi na léčbu. U všech pacientů zařazených do této studie budou shromážděny charakteristiky pacienta, nádoru a chirurgického zákroku. Rozdíly mezi charakteristikami budou statisticky porovnány mezi pacienty. Kromě toho budou tyto charakteristiky analyzovány jako možné prediktory přežití pomocí jednorozměrných a vícerozměrných analýz prostřednictvím log-rank testu a Cox-proporcionálních modelů nebezpečí. Tyto vlastnosti budou zahrnovat:

1. Klinické demografické údaje pacienta a nádoru včetně věku, pohlaví, rasy, umístění primárního nádoru, umístění metastáz, stupně nádoru a hladin sacharidového antigenu 19-9 (CA19-9) před a po chemoterapii a před a po resekci.
2. Chemoterapeutické proměnné včetně typu, počtu cyklů, odpovědi a načasování (neoadjuvantní a/nebo adjuvantní).
3. Operativní proměnné zahrnující typ resekce, počet resekovaných lymfatických uzlin, vaskulární blízkost tumoru, histopatologii a pooperační mortalitu a komplikace.
4. Dlouhodobé proměnné včetně přítomnosti a místa recidivy a stavu (živý/mrtvý).
5. Hladiny specifických biomarkerů v různých časových bodech odběrů krve.
6. Počet cirkulujících nádorových buněk v každém časovém bodě kromě genetických mutací přítomných v buňkách.

U všech pacientů se celkové přežití vypočítá jako doba mezi datem prvního odběru krve před léčbou a datem poslední známé následné návštěvy nebo úmrtím, podle toho, co nastane dříve. U pacientů, kteří podstoupí chirurgickou resekci, vyšetřovatelé vypočítají dobu do recidivy onemocnění měřenou ode dne chirurgické resekce pankreatu do data zdokumentované recidivy onemocnění nebo úmrtí, podle toho, co nastane dříve. Doba do recidivy onemocnění a celkové přežití budou popsány pomocí Kaplan-Meierových křivek a budou porovnány log-rank testem. Celková míra přežití 1 a 5 let bude odhadnuta s 95% intervalem spolehlivosti. Statistická významnost bude nastavena pro p-hodnotu 0,05 nebo nižší.

Primární rizika pro tohoto pacienta budou spojena s odběrem krve, ale nejsou větší než minimální při odběru venepunkcí a nebude odebráno více než 50 ml najednou. K obecným rizikům spojeným s odběrem žilní krve patří modřiny nebo drobné krvácení v místě žilní punkce, které by bylo zvládnuto tlakem.

V této studii nebude pro pacienty žádný přímý přínos, protože získané výsledky nebudou použity pro léčbu těchto pacientů. Tato studie má potenciál být přínosem pro budoucí pacienty tím, že identifikuje metody pro časnou diagnostiku pacientů s rakovinou pankreatu a předpovídá celkové přežití, odpověď na léčbu nebo riziko metastatického šíření a předpovídá recidivu onemocnění, z nichž všechny mají potenciální výhodu zlepšení výsledky této smrtelné nemoci.

Subjektům v této studii nebude poskytnuta žádná odměna. Náklady v této studii budou souviset s náklady na odběry krve během různých plánovaných návštěv kliniky. Těch bude minimum.

Všichni pacienti, kteří souhlasí s účastí v této studii, budou muset podepsat formulář souhlasu s odběrem, skladováním a použitím své krve.