Изменения биомаркеров из крови во времени у пациентов с аденокарциномой поджелудочной железы

Это одноучрежденческое проспективное исследование в больнице Джона Хопкинса, которое будет проводиться с 1 января 2015 года по 31 декабря 2018 года. Все пациенты, которые обращаются в больницу Джона Хопкинса с аденокарциномой поджелудочной железы (PDAC) для оценки лечения химиотерапией, лучевой терапией и / или хирургическим вмешательством, будут приглашены для участия в этом исследовании, но будут включены только те, кто дал согласие на участие в исследовании. . У всех пациентов, давших согласие на участие в этом испытании, будет взята кровь (примерно 50 мл или 3-4 столовые ложки) во время постановки диагноза, но до того, как будет назначено какое-либо лечение. Дальнейшая кровь будет взята после любого лечения. Например, у пациентов, перенесших хирургическую резекцию, перед выпиской также берут кровь после резекции. У тех пациентов, которые проходят лечение химиотерапией, лучевой терапией и / или биологической/вакцинной терапией, берут кровь один раз после завершения этого лечения. Если пациент подвергается химиотерапии, а затем хирургической резекции, у него или нее будет забор крови после химиотерапии, но до хирургической резекции, а затем снова после хирургической резекции, и все это в дополнение к образцу крови до лечения (см. схему, включенную в IRB). В течение первых 2 лет после операции образцы будут собираться каждые 3-4 месяца. Кроме того, исследователи будут собирать образцы каждые 6 месяцев в течение следующих двух лет. У всех пациентов, у которых будет обнаружено, что они живы и не болеют в течение 4 лет после операции, образцы будут собираться один раз в год. Эта кровь будет храниться в исследовательском центре следователей и будет помечена обезличенным кодом. Если пациент отказывается от дальнейших заборов крови в любое время в ходе исследования или теряет возможность последующего наблюдения, образцы, которые были собраны, все равно будут использоваться.

Кровь будет обработана в день сбора, в течение 6 часов после забора. Двадцать (20) мл крови, собранные в две пробирки с пурпурными крышками, будут использоваться для выделения циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК) с помощью анализа выделения эпителиальных опухолевых клеток по размеру (ISET), который разделяет опухолевые клетки по размеру на мембрану. которые можно использовать для дальнейших экспериментов. Эти 20 мл крови будут смешаны с буфером ISET в соответствии со стандартным протоколом и профильтрованы через аппарат ISET на мембраны. Эти мембраны будут храниться при -20°С под неидентифицированным номером и оставаться в этих условиях в течение нескольких лет при полной сохранности клеток. На этих мембранах будут проводиться дальнейшие эксперименты, включающие иммунофлуоресцентное окрашивание, микроскопию с захватом лазером и генетический анализ. Остальные 30 мл крови, собранные в пробирки с красной и пурпурной крышкой, будут обрабатываться по стандартному протоколу в течение 6 часов после сбора. Кровь будет подвергнута двойному центрифугированию для удаления лейкоцитов и плазмы и будет заморожена. Мутации управляющего гена, характерные для резецированных опухолей, будут отслеживаться с помощью цифровой капельной полимеразной цепной реакции (ddPCR), включая гомолог вирусного онкогена крысиной саркомы Кирстен (k-ras), p53, p16/cdkn2a и ген, удаленный при раке поджелудочной железы-4 ( DPC4/SMAD4), чтобы определить наличие ctDNA и повышение уровня.

Данные будут собираться, деидентифицироваться и анализироваться как единый набор данных в больнице Джона Хопкинса. Данные будут получены из электронных и бумажных медицинских карт пациентов из больницы Джона Хопкинса, начиная с 01.01.2015, при этом будут собраны только данные, существующие на 01.01.2015. В частности, будут рассмотрены радиологические, химиотерапевтические, оперативные и патологоанатомические отчеты, выписки и клинические записи, а также собраны данные из этих источников. Для пациентов, потерянных для последующего наблюдения, индекс смерти социального обеспечения (но не потребуется собирать номера социального страхования) будет искать доказательства смерти. Собранные данные о пациентах будут внесены в специальную базу данных. Данные будут собираться только для того, чтобы сопоставить результаты и характеристики опухоли с биомаркерами, выявленными в ходе этого исследования. После накопления данных и до анализа все личные идентификаторы будут удалены, и во время статистического анализа не будет идентифицируемой информации. Сгенерированные данные субъекта не будут отображаться в медицинской карте субъекта и будут использоваться только в исследовательских целях. Данные будут записаны в защищенную паролем безопасную базу данных в офисе главного исследователя и будут доступны только ключевому персоналу. После того, как все данные для конкретного субъекта будут собраны, личность субъекта будет удалена для обеспечения конфиденциальности.

Данные, собранные в этом исследовании, не будут использоваться для клинического ведения пациентов, участвующих в исследовании.

Критерии включения/исключения

Исследователи будут включать всех пациентов, которые обращаются в больницу Джона Хопкинса для лечения с диагнозом аденокарциномы поджелудочной железы. Субъекты будут включены только в том случае, если они старше 18 лет и планируют пройти лечение в больнице Джона Хопкинса. Все пациенты с непервичными опухолями поджелудочной железы, нейроэндокринными опухолями поджелудочной железы или доброкачественными образованиями поджелудочной железы будут исключены. Пациенты будут исключены, если они уже проходили какое-либо лечение в другом учреждении.

Исследователи стремятся включить данные по крайней мере 200 пациентов за три года этого исследования. Первичным результатом будет определение биомаркеров в крови пациентов с аденокарциномой поджелудочной железы и изменений этих биомаркеров с течением времени в связи с лечением. Эти биомаркеры будут включать специфические антитела, циркулирующие опухолевые клетки (ЦОК) и циркулирующую опухолевую ДНК (цДНК). Вторичные результаты будут включать связь уровней биомаркеров до лечения или изменений уровней биомаркеров с безрецидивной и общей выживаемостью, риском метастазов, рецидивом заболевания и ответом на лечение. Пациенты, опухоли и хирургические характеристики будут собраны для всех пациентов, включенных в это исследование. Различия между характеристиками будут статистически сравниваться между пациентами. Кроме того, эти характеристики будут проанализированы как возможные предикторы выживания с использованием одномерного и многомерного анализа с помощью логарифмического рангового теста и моделей пропорционального риска Кокса. Эти характеристики будут включать:

1. Клинические демографические данные пациента и опухоли, включая возраст, пол, расу, расположение первичной опухоли, расположение метастазов, степень опухоли и уровни углеводного антигена 19-9 (CA19-9) до и после химиотерапии, а также до и после резекции.
2. Переменные химиотерапии, включая тип, количество циклов, ответ и сроки (неоадъювантная и/или адъювантная).
3. Операционные переменные, включая тип резекции, количество резецированных лимфатических узлов, сосудистую близость к опухоли, гистопатологию, послеоперационную смертность и осложнения.
4. Долгосрочные переменные, включая наличие и местонахождение рецидива и статус (живой/мертвый).
5. Уровни конкретных биомаркеров в различные моменты времени забора крови.
6. Количество циркулирующих опухолевых клеток в каждый момент времени в дополнение к генетическим мутациям, присутствующим в клетках.

Для всех пациентов общая выживаемость будет рассчитываться как время между датой первого забора крови перед лечением и датой последнего известного последующего визита или смерти, в зависимости от того, что наступит раньше. Для пациентов, перенесших хирургическую резекцию, исследователи рассчитывают время до рецидива заболевания, измеряемое со дня операции по резекции поджелудочной железы до даты документально подтвержденного рецидива заболевания или смерти, в зависимости от того, что наступит раньше. Время до рецидива заболевания и общую выживаемость будут описывать кривыми Каплана-Мейера и сравнивать их с помощью логарифмического рангового критерия. 1-летняя и 5-летняя общая выживаемость будет оцениваться с 95% доверительным интервалом. Статистическая значимость будет установлена ​​для p-значения на уровне 0,05 или ниже.

Основные риски для этого пациента будут связаны со сбором крови, но они не превышают минимальные при взятии крови путем венепункции, и за один раз будет взято не более 50 мл. Общие риски, связанные с забором венозной крови, включают кровоподтеки или незначительное кровотечение в месте венозной пункции, которое можно остановить с помощью давления.

В этом исследовании не будет прямой пользы для пациентов, поскольку полученные результаты не будут использоваться для лечения этих пациентов. Это исследование может принести пользу будущим пациентам, определяя методы ранней диагностики пациентов с раком поджелудочной железы и прогнозируя общую выживаемость, ответ на лечение или риск метастатического распространения, а также прогнозируя рецидив заболевания, все из которых имеют потенциальное преимущество улучшения Исходы этого смертельного заболевания.

В этом исследовании компенсация не выплачивается испытуемым. Затраты в этом исследовании будут связаны со стоимостью забора крови во время различных плановых визитов в клинику. Они будут минимальными.

Все пациенты, которые согласятся участвовать в этом исследовании, должны будут подписать форму согласия на сбор, хранение и использование их крови.