Podávání autologních T-buněk geneticky upravených k expresi T-buněčných receptorů reaktivních proti neoantigenům u lidí s metastatickým karcinomem

Pozadí:

• Podání autologních tumor-infiltrujících lymfocytů (TIL) může zprostředkovat kompletní, trvalé regrese u 20–25 % účastníků s metastatickým melanomem. Nedávné studie ukázaly, že tyto TIL převážně rozpoznávají jedinečné mutované neoantigeny exprimované rakovinou, kterou nesdílejí jiné melanomy.
• Podání hromadného autologního TIL účastníkům s řadou dalších solidních nádorů, včetně nádorů gastrointestinálního traktu a genitourinárního traktu, má malý, pokud vůbec nějaký, terapeutický dopad.
• Nedávné studie v National Cancer Institute Surgery Branch (NCI-SB) ukázaly, že TIL z nemelanomových pevných rakovin může také obsahovat T-buňky reaktivní proti nesdíleným jedinečným mutovaným nebo onkovirálním neoantigenům exprimovaným v rakovině. Frekvence těchto T-buněk je velmi nízká (často < 0,1 %), a proto je obtížné izolovat a pěstovat mutační reaktivní T-buňky na úrovně potřebné pro účinnou terapii.
• U jediného pacienta s chemo-refrakterním metastazujícím cholangiokarcinomem jsme byli schopni vypěstovat relativně čistou populaci neoantigenně reaktivního TIL a podání těchto buněk zprostředkovalo téměř úplnou regresi všech metastatických onemocnění, která nyní trvá 2,5 roku.
• Vyvinuli jsme přístupy k identifikaci těchto vzácných neoantigenně reaktivních T-buněk z běžných nemelanomových rakovin, k izolaci jejich receptorů T-buněk (TCR) a ke genetickému inženýrství autologních lymfocytů periferní krve (PBL) k expresi těchto TCR s vysokou účinností. Neoantigenní TCR genem modifikované buňky mohou rozpoznat a zničit autologní rakovinu in vitro.
• Kromě reaktivity na neoantigeny odvozené z nesynonymních mutací mohou T-buňky rozpoznat epitopy lidského papilomaviru (HPV) u účastníků s rakovinou vyvolanou HPV. TCR z těchto reaktivních buněk může být izolován a retrovirově transdukován do autologních PBL s vysokou účinností.
• Pomocí těchto technik jsme izolovali řadu TCR selektivně rozpoznávajících sdílené mutované onkogeny (např. KRAS, TP53) nebo sdílené onkovirální proteiny (např. HPV) v kontextu několika hlavních histokompatibilních komplexů (MHC-I a MHC-II).
• Tento klinický protokol bude léčit účastníky s refrakterními solidními rakovinami pomocí adoptivního přenosu autologních PBL transdukovaných geny kódujícími TCR, které rozpoznávají jedinečné mutované nebo onkovirální neoantigeny exprimované rakovinou.

Cíle:

- Primární cíl:

– Určete míru objektivní odpovědi (pomocí kritérií RECIST v1.1) účastníků se solidními nádory, kteří dostávají pembrolizumab plus autologní PBL (rameno 2), které byly transdukovány geny kódujícími receptory T-buněk, které rozpoznávají mutované nebo onkovirální neoantigeny v autologní rakovina

Způsobilost:

- Účastníci musí být/mít:

• Věk vyšší nebo rovný 18 let a nižší nebo rovný 70 letům
• Metastatická solidní rakovina s alespoň jednou lézí, kterou lze měřit, která spadá do jedné z pěti kohort: (1) gastrointestinální a genitourinární rakoviny; (2) rakovina prsu, vaječníků a další solidní rakoviny; (3) nemalobuněčný karcinom plic (NSCLC); a (4) endokrinní nádory včetně neuroendokrinních nádorů a (5) mnohočetný myelom s pevnými masami (plazmacytomy).
• Hodnotitelná solidní rakovina, která se recidivovala po standardní chemoterapii nebo standardní systémové terapii
• Normální základní laboratorní hodnoty.
• Žádné alergie ani přecitlivělost na podávání vysokých dávek aldesleukinu
• Žádná souběžná závažná zdravotní onemocnění nebo jakákoli forma imunodeficience.

Design:

• Účastníci již podstoupili resekci nebo biopsii, aby získali nádor pro vytvoření autologních kultur TIL. To bude provedeno podle protokolu sklizně buněk NCI-SB 03-C-0277 (Protokoly buněčné sklizně a přípravy na adoptivní buněčnou terapii chirurgické větve).
• Exomické sekvenování a často RNA-Seq bude provedeno k identifikaci mutací exprimovaných v pacientově rakovině. Mnohonásobné autologní kultury TIL budou pěstovány a testovány na reaktivitu proti mutacím z autologního nádoru pomocí námi vyvinutých testů, které zahrnují expozici buněk prezentujících autologní antigen dlouhým peptidům obsahujícím mutaci nebo tandemovým minigenům kódujícím mutaci.
• Budou identifikovány kultury T lymfocytů s reaktivitou proti mutacím a jednotlivé receptory T lymfocytů, které mutaci rozpoznávají, budou syntetizovány a použity k vytvoření retroviru pro transdukci TCR do autologní PBL pacienta.
• Účastníci, kteří mají nádory exprimující onkovirální neoantigeny, budou léčeni autologními PBL retrovirově transdukovanými TCR cílícími na onkovirový neoantigen.
• Účastníci, kteří vykazují nádory exprimující mutované sdílené onkogeny (např. KRAS, TP53) nebo onkovirální proteiny (např. HPV), které také exprimují příslušný restrikční element, mohou být léčeni autologními PBL retrovirálně transdukovanými TCR (y) dříve izolovanými v chirurgickém oddělení cílení na sdílený mutovaný antigen. Těmto účastníkům bude podáván buněčný infuzní produkt TCR zaměřený na mutované sdílené onkogeny (např. KRAS, TP53) nebo onkovirální proteiny (např. HPV). Jejich buněčný infuzní produkt nebude obsahovat PBL transdukovaný jedinečným (tj. nesdíleným) TCR(y).
• Účastníci budou zařazeni do jedné z pěti kohort: (1) metastatické gastrointestinální a genitourinární rakoviny; (2) metastatické rakoviny prsu, vaječníků a jiné solidní rakoviny; (3) metastatický nemalobuněčný karcinom plic (NSCLC); (4) metastatické endokrinní nádory včetně neuroendokrinních nádorů a (5) mnohočetný myelom se solidními masami (plazmacytomy). Autologní PBL transdukované TCR(y) cílícími neoantigeny (mutované sdílené onkogeny, např. TP53, KRAS, individuální nesynonymní mutace nebo onkovirální proteiny) budou poté rozšířeny na velká množství pomocí našeho standardního protokolu rychlé expanze.
• Účastníci zařazení do ramene 1 a ramene 2 dostanou nemyeloablativní, lymfodepleční preparativní režim sestávající z cyklofosfamidu a fludarabinu s následnou infuzí autologního transdukovaného PBL a vysokých dávek aldesleukinu. Podle uvážení hlavního zkoušejícího (PI) mohou účastníci zařazení do kohorty 3 (NSCLC) dostávat nízké dávky aldesleukinu.
• Účastníci zařazení do ramene 2 dostanou pembrolizumab před podáním buněk a tři další dávky každé tři týdny po infuzi buněk. Účastníci, kteří zaznamenali velkou orgánovou toxicitu v důsledku předchozí léčby pembrolizumabem (nebo ekvivalentní blokádou PD-1/PD-L1), budou zařazeni do ramene 1.
• Klinická a imunologická odpověď bude hodnocena přibližně 4-6 týdnů po infuzi buněk a poté pravidelně.
• Předpokládá se, že přibližně jeden účastník za měsíc se může zapsat do studie pro každou ze čtyř histologických kohort pro větev 2. Bude omezen počet 15 účastníků na kohortu zapsanou v větvi 1 (75 účastníků pro větev 1) a přírůstek až 4 x 50 = 200 celkových hodnotitelných účastníků na větvi 2. Očekává se, že jakmile bude dosaženo plné výrobní kapacity, může být časové rozlišení dokončeno přibližně za 4–5 let. Aby byl umožněn malý počet neocenitelných účastníků, bude akruální strop stanoven na 285.