Administrering av autologe T-celler genetisk konstruert for å uttrykke T-cellereseptorer som er reaktive mot neoantigener hos personer med metastatisk kreft

Bakgrunn:

• Administrering av autologe tumorinfiltrerende lymfocytter (TIL) kan mediere fullstendige, varige regresjoner hos 20-25 % av deltakerne med metastatisk melanom. Nyere studier har vist at disse TIL overveiende gjenkjenner unike muterte neoantigener uttrykt av kreften som ikke deles av andre melanomer.
• Administrering av bulk autolog TIL til deltakere med en rekke andre solide kreftformer, inkludert kreft i mage-tarmkanalen og genitourinary tractus, har liten eller ingen terapeutisk effekt.
• Nyere studier i National Cancer Institute Surgery Branch, (NCI-SB), har vist at TIL fra ikke-melanom solide kreftformer også kan inneholde T-celler som er reaktive mot ikke-delte unike muterte eller onkovirale neoantigener uttrykt i kreften. Frekvensen av disse T-cellene er svært lav (ofte < 0,1%) og det er derfor vanskelig å isolere og dyrke mutasjonsreaktive T-celler til nivåer som kreves for effektiv terapi.
• Hos en enkelt pasient med kjemo-refraktær metastatisk kolangiokarsinom var vi i stand til å vokse en relativt ren populasjon av neoantigen-reaktiv TIL og administrering av disse cellene medierte en nesten fullstendig regresjon av all metastatisk sykdom som nå varte i 2,5 år.
• Vi har utviklet tilnærminger for å identifisere disse sjeldne neoantigen-reaktive T-cellene fra vanlige ikke-melanomkreftformer, for å isolere deres T-cellereseptorer (TCR), og for å genetisk konstruere autologe perifere blodlymfocytter (PBL) for å uttrykke disse TCR-ene med høy effektivitet. De neoantigen TCR genmodifiserte cellene kan gjenkjenne og ødelegge den autologe kreften in vitro.
• I tillegg til reaktivitet mot neoantigener avledet fra ikke-synonyme mutasjoner, kan T-celler gjenkjenne humant papillomavirus (HPV) epitoper hos deltakere med HPV-indusert kreft. TCR fra disse reaktive cellene kan isoleres og retroviralt transduseres til autolog PBL med høy effektivitet.
• Med disse teknikkene har vi isolert en rekke TCR-er som selektivt gjenkjenner delte muterte onkogener (f.eks. KRAS, TP53) eller delte oncovirale proteiner (f. HPV) i sammenheng med flere store histokompatibilitetskomplekser (MHC-I og MHC-II).
• Denne kliniske protokollen vil behandle deltakere med ildfaste faste kreftformer ved bruk av adoptiv overføring av autolog PBL transdusert med gener som koder for TCR-er som gjenkjenner unike muterte eller onkovirale neoantigener uttrykt av kreften.

Mål:

-Hovedmål:

-- Bestem graden av objektiv respons (ved hjelp av RECIST v1.1-kriterier) for deltakere med solide kreftformer som mottar pembrolizumab pluss autolog PBL (arm 2) som har blitt transdusert med gener som koder for T-cellereseptorer som gjenkjenner muterte eller onkovirale neoantigener i autolog kreft

Kvalifisering:

- Deltakere må være/ha:

• Alder over eller lik 18 år og under eller lik 70 år
• Metastatisk solid kreft med minst én lesjon som kan måles, som faller inn i en av fem kohorter: (1) gastrointestinale og genitourinære kreftformer; (2) brystkreft, eggstokkreft og andre solide kreftformer; (3) ikke-småcellet lungekreft (NSCLC); og, (4) endokrine svulster inkludert nevroendokrine svulster og, (5) multippelt myelom med faste masser (plasmacytomer).
• Evaluerbar solid kreft som har gjentatt seg etter standard kjemoterapi eller standard systemisk terapi
• Normale grunnleggende laboratorieverdier.
• Ingen allergier eller overfølsomhet overfor høydose aldesleukinadministrasjon
• Ingen samtidige store medisinske sykdommer eller noen form for immunsvikt.

Design:

• Deltakerne vil allerede ha gjennomgått reseksjon eller biopsi for å oppnå tumor for generering av autologe TIL-kulturer. Dette vil ha blitt utført under NCI-SB cellehøstprotokoll 03-C-0277 (Cell Harvest and Preparation for Surgery Branch Adoptive Cell Therapy Protocols).
• Eksomisk sekvensering, og ofte RNA-Seq, vil bli utført for å identifisere mutasjonene uttrykt i pasientens kreft. Flere autologe TIL-kulturer vil bli dyrket og testet for reaktivitet mot mutasjoner fra den autologe svulsten ved å bruke analyser vi har utviklet som involverer eksponering av autologe antigen-presenterende celler for lange peptider som inneholder mutasjonen eller tandem-mini-genene som koder for mutasjonen.
• T-cellekulturer med reaktivitet mot mutasjoner vil bli identifisert og de individuelle T-cellereseptorene som gjenkjenner mutasjonen vil bli syntetisert og brukt til å lage et retrovirus for transduksjon av TCR til pasientens autologe PBL.
• Deltakere som presenterer med svulster som uttrykker onkovirale neoantigener, vil bli behandlet med autologe PBLer retroviralt transdusert med TCR(er) rettet mot det onkovirale neoantigenet.
• Deltakere som presenterer med svulster som uttrykker muterte delte onkogener (f.eks. KRAS, TP53) eller onkovirale proteiner (f.eks. HPV) som også uttrykker det passende restriksjonselementet, kan behandles med autologe PBLer retroviralt transdusert med TCR(er) tidligere isolert i kirurgisk gren. retter seg mot det delte muterte antigenet. Disse deltakerne vil bli administrert et celleinfusjonsprodukt av TCR-er rettet mot muterte delte onkogener (f.eks. KRAS, TP53) eller onkovirale proteiner (f.eks. HPV). Deres celleinfusjonsprodukt vil ikke inkludere PBL transdusert med unike (dvs. ikke-delte) TCR(er).
• Deltakerne vil bli registrert i en av fem kohorter: (1) metastaserende gastrointestinale og genitourinære kreftformer; (2) metastaserende brystkreft, eggstokkreft og andre solide kreftformer; (3) metastatisk ikke-småcellet lungekreft (NSCLC); (4) metastatiske endokrine svulster inkludert nevroendokrine svulster og, (5) multippelt myelom med faste masser (plasmacytomer). Autolog PBL transdusert med TCR(er) rettet mot neoantigener (muterte delte onkogener, f.eks. TP53, KRAS, individuelle ikke-synonyme mutasjoner eller onkovirale proteiner) vil deretter bli utvidet til et stort antall ved å bruke vår standard hurtigekspansjonsprotokoll.
• Deltakere som er registrert på arm 1 og arm 2 vil motta et ikke-myeloablativt, lymfodepletterende preparativt regime bestående av cyklofosfamid og fludarabin etterfulgt av infusjon av autolog transdusert PBL og høydose aldesleukin. Etter hovedetterforskerens (PI) skjønn kan deltakere som er registrert i kohort 3 (NSCLC) motta lavdose aldesleukin.
• Deltakere som er registrert på arm 2 vil motta pembrolizumab før celleadministrering og tre tilleggsdoser hver tredje uke etter celleinfusjonen. Deltakere som har opplevd alvorlig organtoksisitet på grunn av tidligere behandling med pembrolizumab (eller tilsvarende PD-1/PD-L1-blokade) vil bli registrert på arm 1.
• Klinisk og immunologisk respons vil bli evaluert ca. 4-6 uker etter celleinfusjon og periodisk deretter.
• Det er forventet at omtrent én deltaker per måned kan melde seg på prøven for hver av de fire histologiske kohortene for arm 2. Det vil være en grense på 15 deltakere per påmeldt kohort på arm 1 (75 deltakere for arm 1), og opptjening av opptil 4 x 50 = 200 totalt evaluerbare deltakere på arm 2. Det forventes at når full produksjonskapasitet er nådd, kan opptjeningen fullføres i løpet av ca. 4-5 år. For å gi rom for et lite antall uvurderlige deltakere, settes opptjeningstaket til 285.