Včasná předpověď sepse pomocí metabolomiky (EPoS)

V minulosti byly studie predikce a prognózy sepse zaměřeny na hladiny proteinu a genu a v oblasti metabolomiky bylo provedeno jen málo výzkumů. Ve skutečnosti se změny ve fungování biologických systémů mohou projevit nejen specificky exprimovaným proteinem, ale také metabolismem. Metabolická charakteristika biologických tekutin se výrazně změní, když tělo trpí patologickou nebo fyziologickou stimulací, a tyto změny mohou odhalit stav nebo závažnost onemocnění, zatímco funkce orgánu zůstává normální díky kompenzačnímu působení. Proto je možné předpovědět výskyt, vývoj a prognózu sepse v časném stadiu pomocí detekce koncentrací nebo poměrů těchto metabolitů. Tradiční metody se obtížně přizpůsobují detekci tak komplikovaných změn v metabolických profilech při výskytu sepse, takže existuje obrovská poptávka po nových prostředcích pro metabolické profilování při zánětlivé reakci. Dosud bylo provedeno několik výzkumů zabývajících se metabolickým profilováním u těžkých ran, ale jen málo z nich bylo provedeno v oblasti medicíny intenzivní péče. Metabolické profily u pacientů se sepsí zůstaly dosud nejasné. Proto je velmi důležité vyvinout přístup metabolického profilování pro měření a interpretaci metabolitů z biologických vzorků pacientů se sepsí a vytvořit způsob pro časnou predikci sepse založenou na metabolomice.

K dosažení cíle metabolického profilování u pacientů se sepsí nebo bez ní bude použito několik kvalitativních a kvantitativních detekčních metod. K pochopení metabolického profilu bude použita metodologie analýzy hlavních komponent (PCA) a analýzy parciální diskriminace nejmenších čtverců (PLS-DA). Data budou analyzována softwarovým balíkem Mestrec a MestReNova a vyhledáváním v databázi lidských metabolomů (HMDB) s cílem identifikovat biomarkery pro predikci sepse. Biomarkery, které se změnily nejvíce, budou ověřeny pomocí kapalinové chromatografie-hmotnostní spektrometrie (LC-MS).