A szepszis korai előrejelzése metabolomika segítségével (EPoS)

A múltban a szepszis előrejelzésével és prognózisával foglalkozó tanulmányok a fehérje- és génszintekre összpontosultak, a metabolomika területén kevés kutatás történt. Valójában a biológiai rendszerek működésében bekövetkezett változásokat nemcsak a specifikusan expresszálódó fehérje, hanem az anyagcsere is tükrözheti. A biológiai folyadékok anyagcsere jellemzői jelentősen megváltoznak, ha a szervezet kóros vagy fiziológiás stimulációt szenved el, és ezek a változások feltárhatják a betegség állapotát vagy súlyosságát, miközben a kompenzációs hatásnak köszönhetően a szervi működés normális marad. Ezért lehetséges a szepszis előfordulása, kialakulása és prognózisa a korai stádiumban előre jelezni ezen metabolitok koncentrációjának vagy arányának kimutatásával. A hagyományos módszerek nehezen adaptálhatók a szepszis fellépésekor a metabolikus profilok ilyen bonyolult változásainak kimutatására, ezért óriási igény mutatkozik újszerű eszközökre a gyulladásos reakciók metabolikus profiljának meghatározására. Súlyos sebek metabolikus profilalkotásával mára már több kutatás is foglalkozott, de a kritikus egészségügyi ellátás területén kevés. A szepszises betegek metabolikus profilja mindeddig tisztázatlan. Ezért nagy jelentőséggel bír egy metabolikus profilalkotási megközelítés kidolgozása a szepszises betegek biológiai mintáiból származó metabolitok mérésére és értelmezésére, valamint egy mód kialakítása a szepszis metabolomikai alapú korai előrejelzésére.

Számos kvalitatív és kvantitatív kimutatási módszert fognak alkalmazni a metabolikus profilalkotás céljának eléréséhez szepszisben szenvedő vagy nem szenvedő betegeknél. A főkomponens-elemzés (PCA) és a részleges legkisebb négyzetek megkülönböztetési elemzése (PLS-DA) módszertant alkalmazzák az anyagcsere-profil megértéséhez. Az adatokat a Mestrec és a MestReNova szoftvercsomag, valamint a Human Metabolome Database (HMDB) elemzi, keresve a szepszis előrejelzéséhez szükséges biomarkereket. A leginkább megváltozott biomarkereket folyadékkromatográfiás tömegspektrometriával (LC-MS) fogják ellenőrizni.