Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Brug af langlæst genomsekvensering hos patienter, der lider af neurodevelopmental problemer (HiFi-NDD)

23. april 2024 opdateret af: Nantes University Hospital

Patienter med neuroudviklingssygdomme og deres familier skal identificere den genetiske årsag til sygdommen for at give mulighed for anerkendelse af handicappet, genetisk rådgivning og muligt håb om deltagelse i terapeutiske forskningsstudier. Adgang til high-throughput genomisk exom- eller genomanalyse tillader identifikation af en genetisk årsag for cirka halvdelen af ​​patienterne. Familier uden resultat eller med en variant af ukendt betydning efter disse test kan dog befinde sig i et nyt diagnostisk dødvande.

Den high-throughput sekventering, der anvendes i dag, genererer sekvenser af størrelsesordenen 100 basepar (såkaldt "short read" sekventering). Dette tillader en analyse af omkring 90% af genomet. Imidlertid er mange regioner ikke tilgængelige i områder af interesse for genetisk diagnose af sjældne sygdomme. Lang fragmentsekventering genererer sekvenser, der er omkring 20 gange større, og brugen heraf har for nylig gjort det muligt at sekventere det menneskelige genom næsten fuldstændigt (https://www.science.org/doi/10.1126/science.abj6987). Hovedbidraget ligger i analysen af ​​komplekse regioner af genomet, såsom segmentelle duplikationer eller centromere regioner. Det er sandsynligt, at denne teknologi øger følsomheden ved påvisning af genetiske varianter hos patienter med genetiske sygdomme. Dets bidrag bør undersøges hos patienter, for hvilke ingen genetisk årsag er blevet identificeret med klassiske teknikker.

Denne undersøgelse sigter mod at undersøge bidraget af lange fragmentgenomsekventering.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

Ti familier med et barn, der lider af en neuroudviklingssygdom, vil blive rekrutteret af genetikere, der er en del af CLAD-Ouest. Der vil blive taget en EDTA-blodprøve fra patienten og dennes forældre (trioanalyse). Blodprøverne vil derefter blive brugt til at udvinde nukleinsyrer (DNA).

Blodprøverne vil blive sendt og centraliseret til genetiklaboratoriet på Nantes Universitetshospital. DNA'et vil blive ekstraheret og anonymiseret.

Filerne, der genereres efter DNA-sekventering, vil som identifikationsnøgle have det anonymiseringsnummer, der blev oplyst på tidspunktet for inklusion af individet i undersøgelsen. De rå data og VCF-filer vil blive uploadet til BIRD-computerklyngen i Nantes, hvor de vil blive opbevaret i hele undersøgelsens varighed (2 år). De forskellige universitetshospitaler vil derefter være i stand til at hente dataene og analysere de varianter, der er identificeret hos patienterne rekrutteret af deres center. En centraliseret analyse for at kommentere, filtrere og fortolke varianterne vil blive udført af en gruppe bioinformatikere og biologer fra HUGO (Universitetshospitalet fra Grand Ouest). Langtidsarkivering af dataene vil blive udført på Nantes Universitetshospital.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

10

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Frankrig
    • Finistère
      • Brest, Finistère, Frankrig, 29000
        • Brest University Hospital
    • Ille-et-Vilaine
      • Rennes, Ille-et-Vilaine, Frankrig, 35000
        • Rennes University Hospital
    • Indre-et-Loire
      • Tours, Indre-et-Loire, Frankrig, 37000
        • Tours University Hospital
    • Loire-Atlantique
      • Nantes, Loire-Atlantique, Frankrig, 44093
        • Nantes University Hospital
    • Maine-et-Loire
      • Angers, Maine-et-Loire, Frankrig, 49000
        • Angers University Hospital

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

N/A

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patient med neuroudviklingssygdomme og begge deres forældre

Beskrivelse

Inklusionskriterier for patienter:

  • Patient (barn eller voksen) med neuroudviklingsproblemer, der er stærkt mistænkt for at lide af en sjælden genetisk sygdom (familiær eller meget alvorlig).
  • Negativt resultat for kort læst sekvensering af trioen (barn og forældre).
  • Informeret samtykke til undersøgelsen fra patienten (hvis relevant) eller deres juridiske repræsentanter, hvis de er mindreårige eller under værgemål.
  • Patienter, der nyder godt af den sociale sikring (det franske sundhedssystem).

Inklusionskriterier for forældre:

  • Eventuel rekruttering af begge forældre, der matcher inklusionskriterierne.
  • Formular til informeret samtykke underskrevet for deres egen deltagelse.
  • Forældre, der nyder godt af den sociale sikring (det franske sundhedssystem).

Eksklusionskriterier for patienter:

  • Genetisk disposition allerede identificeret forklarer sygdommen.
  • Paienter, hvor WGS for trioen ikke er blevet udført.
  • Patienter, der har trukket deres samtykke tilbage.

Eksklusionskriterier for forældre:

  • Gravid eller ammende kvinde.
  • Forældre under værgemål eller kuratur.
  • Forældre viser også en neuroudviklingsmangel.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Familiebaseret
  • Tidsperspektiver: Tværsnit

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Deltagere
Patienter med neuroudviklingssygdomme og deres begge forældre

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Brug af lang læst sekvensering hos patienter, der lider af en neuroudviklingssygdom uden patogen eller sandsynligvis patogen variation identificeret ved kort læst sekvensering
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Identifikation af en genetisk diagnose: påvisning af en eller flere variant(er) - nukleotid, ændring i kopiantal, strukturelle varianter - af klasse 4 eller 5 (sandsynligvis patogen eller patogen), der forklarer den genetiske oprindelse af neuroudviklingspatologien
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Analyse af implementeringen af ​​den lange læste sekvensering af trioer (patienter og forældre)
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Måling af fejlfrekvensen af ​​lang læst sekventering, vendingstid mellem sekventering og resultater tilgængelige for klinisk team
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Nantes University Hospital

Samarbejdspartnere

University Hospital, Angers
University Hospital, Brest
Rennes University Hospital
University Hospital, Tours

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Stéphane BEZIEAU, MD, Nantes University Hospital

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

19. december 2022

Primær færdiggørelse (Faktiske)

8. marts 2023

Studieafslutning (Faktiske)

8. marts 2024

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

22. november 2022

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

1. december 2022

Først opslået (Faktiske)

8. december 2022

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

24. april 2024

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

23. april 2024

Sidst verificeret

1. april 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • RC22_0373

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

UBESLUTET

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Vækstforstyrrelser

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Senegal

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner