Transmission og erhvervelse af ikke-tuberkuløse mykobakterier udbrudsundersøgelse (TrANsMIT) (C)

Denne undersøgelse er en parallel multi-site undersøgelse af personer, der behandles i et sundhedscenter, og som er identificeret med meget lignende respiratoriske NTM-isolater. Advanced Diagnositc Laboratories (ADx) biorepository indsamler ikke-standardiserede, frivilligt indsendte respiratoriske isolater fra sundhedscentre i hele USA med henblik på dyrkning, molekylær identifikation og WGS. TRANsMIt-undersøgelsen er designet til at give ressourcer til systematisk at indsamle data for at udføre en udbrudsundersøgelse på personer i et formodet sundhedsrelateret NTM-udbrud. Respiratoriske NTM-isolater vil gennemgå WGS for at identificere infektioner, der er meget beslægtede og falder i klynger for at afgøre, om kilden til NTM-infektion kan være et sundhedsrelateret udbrud. Efterforskerne integrerede kliniske og epidemiologiske forskningsmetoder for at tilpasse et CDC-standardiseret og valideret Healthcare-Associated Infection Outbreak Investigation Toolkit til retrospektivt at indsamle data for mistænkte sundhedsrelaterede NTM-udbrudsundersøgelser. Gennem konsultation med emneeksperter og videnskabelig litteraturgennemgang ændrede efterforskerne CDC Healthcare-Associated Infection Outbreak Investigation Abstraction Form, designet til at blive brugt i lokale undersøgelser af almindelige sundhedsrelaterede infektioner for at udvikle HALT NTM Outbreak Investigation Abstraction Toolkit. HALT NTM Toolkit er et HIPAA-kompatibelt, webbaseret, forgrenet logik-spørgeskema, der bruger integrerede kliniske og epidemiologiske forskningsmetoder til at udføre en epidemiologisk undersøgelse for at identificere overlapninger i rum og tid med kortlægning af besøg og kilde(r) til behandling blandt patienter med meget lignende NTM-isolater i et center. Derudover vurderer værktøjssættet detaljerede Center-specifikke IP&C-foranstaltninger, der anvendes i sundhedssystemet. Ved at bruge HALT NTM-værktøjssættet letter TrANsMit-undersøgelsen en standardiseret, trinvis proces, hvor sundhedscentre udfører en intern epidemiologisk evaluering af patienter identificeret som en del af en NTM-klynge. Da klyngede NTM-isolater kunne stamme fra en fælles sundhedskilde, indsamles støv- og vandbiofilm fra sundhedsmiljøet. NTM gendannes, identificeres og sekventeres som beskrevet for at bestemme, om den respiratoriske NTM-stamme-genotype svarer til dem, der udvindes fra sundhedsmiljøet. Gennem en samarbejdsaftale er TRANsMIt tilgængelig for amerikanske sundhedscentre til at udføre en standardiseret, uafhængig, fortrolig NTM-udbrudsundersøgelse.