Le microbiome cutané dans la maladie du greffon contre l'hôte

patients atteints de GVHD après allo-GCSH

Exploration du microbiote cutané chez les patients atteints de GVHD après allo-GCSH par prélèvement d'écouvillons cutanés et biopsie cutanée à l'emporte-pièce avant la procédure de conditionnement et biopsies cutanées supplémentaires des sites cutanés affectés et sains en cas de GVHD

Test diagnostique: Écouvillons cutanés

Des écouvillons cutanés pré-humidifiés seront prélevés avant que le patient ne commence les régimes de conditionnement (avant le conditionnement ; début de la GCSH = jour 0, le jour de la transplantation et répété aux semaines 4, 12, 24, 36 et 52 après l'allo-GCSH . Le premier écouvillon sert de référence de base (idéalement prélevé au plus tôt une semaine après un traitement antibiotique systémique). Des écouvillons seront prélevés dans le cou, le dos, la hanche droite, la cavité buccale et les muqueuses génitales. Chez les patients qui développent une GVHD cutanée aiguë ou chronique, des écouvillons supplémentaires seront prélevés sur la peau affectée au moment du diagnostic, puis à nouveau selon le calendrier des écouvillons cutanés non lésés.

Test diagnostique: Biopsies cutanées à l'emporte-pièce

Lors de la première visite, une biopsie cutanée unique sera effectuée pour indiquer l'état de la peau et le microbiome avant l'allo-HSCT. D'autres biopsies ne seront réalisées qu'en cas de GVHD cutanée aiguë ou chronique. Une biopsie à l'emporte-pièce de 4 à 6 mm sera prélevée sur la zone cutanée affectée et une seconde sur une partie non affectée de la peau à proximité. Avant la biopsie, une désinfection de la peau sera effectuée pour éviter toute contamination par des bactéries de surface.

Test diagnostique: prise de sang supplémentaire

un tube de sang supplémentaire (2,7 ml) et un tube de sérum supplémentaire (6 ml) seront prélevés et congelés lors des visites 1, 2, 3 et 7 au cours du prélèvement sanguin, afin de pouvoir effectuer d'éventuelles analyses de laboratoire ultérieures tests qui peuvent s'avérer utiles selon le déroulement de l'étude.

patients sans GVHD après allo-GCSH

Exploration du microbiote cutané chez des patients sans GVHD après allo-GCSH par prélèvement de frottis cutanés et biopsie cutanée à l'emporte-pièce avant conditionnement

Test diagnostique: Écouvillons cutanés

Des écouvillons cutanés pré-humidifiés seront prélevés avant que le patient ne commence les régimes de conditionnement (avant le conditionnement ; début de la GCSH = jour 0, le jour de la transplantation et répété aux semaines 4, 12, 24, 36 et 52 après l'allo-GCSH . Le premier écouvillon sert de référence de base (idéalement prélevé au plus tôt une semaine après un traitement antibiotique systémique). Des écouvillons seront prélevés dans le cou, le dos, la hanche droite, la cavité buccale et les muqueuses génitales. Chez les patients qui développent une GVHD cutanée aiguë ou chronique, des écouvillons supplémentaires seront prélevés sur la peau affectée au moment du diagnostic, puis à nouveau selon le calendrier des écouvillons cutanés non lésés.

Test diagnostique: Biopsies cutanées à l'emporte-pièce

Lors de la première visite, une biopsie cutanée unique sera effectuée pour indiquer l'état de la peau et le microbiome avant l'allo-HSCT. D'autres biopsies ne seront réalisées qu'en cas de GVHD cutanée aiguë ou chronique. Une biopsie à l'emporte-pièce de 4 à 6 mm sera prélevée sur la zone cutanée affectée et une seconde sur une partie non affectée de la peau à proximité. Avant la biopsie, une désinfection de la peau sera effectuée pour éviter toute contamination par des bactéries de surface.

Test diagnostique: prise de sang supplémentaire

un tube de sang supplémentaire (2,7 ml) et un tube de sérum supplémentaire (6 ml) seront prélevés et congelés lors des visites 1, 2, 3 et 7 au cours du prélèvement sanguin, afin de pouvoir effectuer d'éventuelles analyses de laboratoire ultérieures tests qui peuvent s'avérer utiles selon le déroulement de l'étude.

Détermination du microbiome bactérien des patients avec GVHD après allo-HSCT vs patients sans GVHD après allo-HSCT

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Détermination du microbiome bactérien des patients avec GVHD après allo-HSCT vs patients sans GVHD après allo-HSCT

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Détermination du microbiome bactérien des patients avec GVHD après allo-HSCT vs patients sans GVHD après allo-HSCT

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Détermination du microbiome bactérien des patients avec GVHD après allo-HSCT vs patients sans GVHD après allo-HSCT

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Détermination du microbiome bactérien des patients avec GVHD après allo-HSCT vs patients sans GVHD après allo-HSCT

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Changement du microbiote cutané dans la peau lésionnelle par rapport à la peau non lésionnelle des patients atteints de GVHD

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Modification du microbiote cutané interindividuel chez les patients allo-GCSH

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Modification du microbiote cutané intra-individuel chez les patients allo-GCSH

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Modification du microbiote cutané en corrélation avec la fréquence et le type d'infections post-transplantation (ex. épisodes de bactériémie).

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Modification de la composition du microbiote cutané en corrélation avec la sévérité de la GVHD

Après lyse du microbiote, l'ADN est extrait pour le séquençage du gène phylogénétique de l'ARN ribosomal 16S (protocole illumina standard), qui est considéré comme l'étalon-or actuel pour déterminer le microbiome bactérien

Modification de l'indice de qualité de vie dermatologique (DLQI)

Il y a 10 questions, couvrant les sujets suivants : symptômes, embarras, achats et soins à domicile, vêtements, social et loisirs, sport, travail ou études, relations proches, sexe, traitement. Chaque question fait référence à l'impact de la maladie de peau sur la vie du patient au cours de la semaine précédente. Chaque question est notée de 0 à 3, donnant une plage de score possible de 0 (signifiant aucun impact de la maladie de peau sur la qualité de vie) à 30 (signifiant un impact maximum sur la qualité de vie).

Changement dans l'échelle d'évaluation numérique des pires démangeaisons (WINRS)

Échelle d'évaluation numérique à un seul élément ancrée à 0 et 10, sur laquelle 0 représente "pas de démangeaisons" et 10 représente "les pires démangeaisons imaginables". Le patient indique la gravité globale des démangeaisons attribuables à son état de peau psoriasique en encerclant le chiffre qui décrit le mieux le pire niveau de démangeaisons au cours des dernières 24 heures.

Modification du questionnaire Eppendorf sur les démangeaisons (EIQ)

Le questionnaire se compose de deux pages, qui sont remplies par le patient. Le formulaire 1 présente 80 descripteurs randomisés. Les items sensoriels sont regroupés sur le côté gauche et les items plus affectifs ou émotionnels de différentes valeurs d'intensité se retrouvent sur le côté droit. Chaque élément est noté entre 0 ("pas vrai") et 4 ("décrit exactement ma sensation de démangeaison"). Les intensités statistiquement évaluables peuvent être dérivées du formulaire 1 pour chaque élément. Le formulaire 2 traite des aspects temporaires et topographiques. Les mesures anti-démangeaisons ("pruritofensives") sont regroupées ici et l'intensité des démangeaisons est évaluée sur une échelle visuelle analogique.

Modification de l'échelle d'anxiété et de dépression hospitalière (HADS)

La HADS est une échelle de quatorze items qui génère des données ordinales. Sept des items se rapportent à l'anxiété et sept à la dépression. Chaque élément du questionnaire est noté de 0 à 3, ce qui signifie qu'une personne peut obtenir un score compris entre 0 et 21 pour l'anxiété ou la dépression. Les scores supérieurs ou égaux à 11 sur l'une ou l'autre échelle indiquent un cas définitif.