Oral Microbiome and Pancreatic Cancer
Oral Microbiome and Pancreatic Cancer: a Prospective Case-Control Study
This is a prospective population based study to examine the relationship of oral and pancreatic microbiome, and their functions, to pancreatic cancer risk.
The identification of specific oral bacteria and their functional relationship to pancreatic cancer will advance scientific knowledge on the etiology of pancreatic cancer. This could provide a new microbially-based research paradigm, possibly leading to new drug targets for this disease. Second, the oral bacteria may serve as a readily accessible, non-invasive biomarker for subsequent pancreatic cancer risk, which help to identify people at high risk of this disease. Finally, the identified oral bacteria may lead to microbial prophylactic preventions, with antibiotic therapy aimed at eradicating the specific species associated with increased cancer risk or, alternatively, combined with probiotics to introduce species that are associated with a decreased cancer risk. Thus, the study outcomes will lead to actionable means for pancreatic cancer prevention.
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
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New York
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New York, New York, Stati Uniti, 10016
- New York University School of Medicine
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Inclusion Criteria:
- DNA extracted from oral wash samples from NIH-PLCO and ACS-CPS cohorts
Exclusion Criteria:
-
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Cases
subjects with histology-confirmed incident pancreatic cancer, with no prior history of cancer (except non-melanoma skin cancer), a valid consent, and pre-diagnostic oral wash samples.
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extraction of genomic DNA from oral samples using the Mobio DNA Isolation Kit.
16S rRNA amplicons covering variable regions V3 to V4 will be generated using primers (347F-5'GGAGGCAGCAGTRRGGAAT'-3' and 803R 5'-CTACCRGGGTATCTAATCC-3')66 incorporating adapters and a sample barcode sequence at PI's lab.
Amplicons will be sequenced with the Roche 454 FLX Titanium sequencing system at the NYU genome technology center, following the manufacturer's specifications.
|
|
Control
selected by incidence density sampling63 among cohort members who had no cancer prior to selection, provided a valid consent and an oral wash.
Controls were frequency matched to cases by cohort, age at cohort entry (5 year), sex, race, and calendar year of cohort entry.
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extraction of genomic DNA from oral samples using the Mobio DNA Isolation Kit.
16S rRNA amplicons covering variable regions V3 to V4 will be generated using primers (347F-5'GGAGGCAGCAGTRRGGAAT'-3' and 803R 5'-CTACCRGGGTATCTAATCC-3')66 incorporating adapters and a sample barcode sequence at PI's lab.
Amplicons will be sequenced with the Roche 454 FLX Titanium sequencing system at the NYU genome technology center, following the manufacturer's specifications.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Presence or absence of bacterial taxa will be compared in oral and pancreatic samples.
Lasso di tempo: 4 Years
|
For the taxa present at both sites, correlation between the abundance of taxa will be examined between the two sites.
To adjust for confounders, multivariate linear regression will be used with abundance of oral taxa (exposure) and that of pancreas taxa (outcome).
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4 Years
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
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Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento primario
Completamento dello studio (Effettivo)
Completamento dello studio
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Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 12-00721
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
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