MONDRIAN: 초기 비소세포폐암에서 정위 체부 방사선 치료를 위한 다중 오믹스 통합 모델링 (MONDRIAN)

전체 연구 계획 기간은 60개월입니다.

프로젝트는 다음과 같이 다섯 가지 주요 작업으로 구성됩니다.

• 작업 1_임상 연구: 자격이 있는 환자로부터 인구 통계, 질병 및 치료 특성, 폐 기능 및 혈구 수 매개 변수를 포함하여 일상적인 임상 데이터를 수집합니다.
• 작업 2_방사체학 연구: 진단용 컴퓨터 단층촬영(CT)과 양전자 방출 단층촬영(PET) 모두에서 정량적 영상 분석을 수행합니다. IBSI(Imaging Biomarker Standardization Initiative)를 준수하는 소프트웨어를 사용하여 기준선 및 첫 번째 임상 진행(또는 마지막 사용 가능한 후속 조치 중 먼저 도래하는 시점)에서 방사성 특징을 추출합니다. 임상적으로 확립된 정성적 및 반정량적 지표(예: CT 이미지의 흉막 삼출 및 PET 이미지의 표준화된 흡수 값)도 검색됩니다.
• 작업 3_유전자 발현 연구: 유전자 발현 프로파일링은 예후 전처리 서명의 존재를 조사하기 위해 두 코호트 모두에서 기준선에서 수행됩니다. 분석은 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 샘플(즉, 수술 코호트에서 절제된 종양 및 SBRT 그룹에서 이용 가능한 경우 바이옵틱 샘플)에서 수행됩니다. 395개의 면역 관련 유전자를 표적으로 하고 Oncomine™ Immune Response Research Assay로 명명된 차세대 시퀀싱(NGS) 기반 분석이 사용됩니다.
• 작업 4_Proteomics 연구: Proteomics는 작업 3에서 수행된 RNA 발현 연구를 통합합니다. 작업 3에서와 같이 분석은 두 환자 코호트의 FFPE 샘플에서 수행됩니다.
• 작업 5_ 통합 모델 구축: 질병 진행 위험이 높은 개인과 낮은 개인의 정확한 추정치를 결정하고 동시에 관련 예측 요인을 식별할 수 있는 고유한 분류 모델에 이전의 모든 기능을 통합합니다. 제안된 분류 모델은 다층 심층 신경망을 사용하여 다양한 소스의 데이터를 통합합니다. 연합 학습 기술은 특정 시험 또는 데이터 소스의 선택으로 인한 편향을 줄이는 데에도 사용됩니다.