비침습적 산전 배제 진단의 보건경제학적 평가 (PRENATSAFE)

어머니의 혈액에서 소량의 순환하는 세포 없는 태아 DNA(ccffDNA)가 발견된 이후, 단순한 혈액 샘플을 사용한 비침습적 산전 진단(NIPD) 기술이 개발되어 1) 염색체 이상을 선별하고, 2) 태아 성별을 진단하며, 3) 어머니가 가지고 있지 않은 변이를 검출(PCR에 의한 배제 NIPD)할 수 있게 되었습니다.

PCR에 의한 배제 NIPD는 현재 특정 일반적인 변이에 대해 가능하지만, 각 변이에 대해 개발하는 데 센터당 3-6주가 소요됩니다. PCR NIPD의 개발 과정은 검사된 각 변이에 대해 길고 비용이 많이 들어, 이 기술에 대한 접근을 제한합니다. 실제로, 프랑스에서는 심각한 단일유전자 질환을 전달할 위험이 있는 부부에게 이 기술이 널리 제공되지 않고 있으며, 이는 많은 수의 다른 유전자와 주어진 유전자의 다중 변이 때문입니다.

차세대 염기서열 분석(NGS)은 수백만 개의 염기서열 분석 반응을 동시에 병렬로 실행하는 것을 기반으로 하여, 동일한 뉴클레오티드 서열을 수백 번 염기서열 분석할 수 있게 합니다. 이는 염기서열 분석된 염기의 성질에 대한 정성적 정보와 염기가 염기서열 분석된 횟수(리드)에 대한 정량적 정보를 제공합니다. 전체 게놈의 약 2%만 분석할 수 있지만, 엑솜의 NGS 염기서열 분석은 우리 게놈의 약 22,000개 유전자의 거의 모든 엑손에 해당합니다. 그러나 이는 많은 양의 데이터를 생성하여 추가 비용을 초래합니다.

진단 실험실에서 널리 채택된 이후, 일부 팀은 병원성 변이를 배제하기 위한 NGS 기반 NIPD를 개발했습니다. 이는 추가 개발 단계 없이도 다중 병원성 변이를 분석할 수 있게 합니다. 그들은 NGS 기반 NIPD가 강력하고 신뢰할 수 있는 기술이지만 추가 시약 비용이 발생한다는 것을 입증했습니다.

프랑스에서는 가족력으로 인해 매년 1,700~1,800건의 단일유전자 질환에 대한 산전 진단 검사(PND)가 수행됩니다. PrenatSafe 프로젝트에서 제안한 바와 같이, 침습적 PND를 받는 부부의 35~40%는 NGS에 의한 NIPD의 혜택을 받을 수 있습니다. PCR이나 NGS에 의한 NIPD의 가용성 증가는 장기적으로 부부의 수요에도 영향을 미칠 수 있습니다. 프랑스에서는 NGS에 의한 NIPD의 도입이 NIPD 요청 증가로 이어질 가능성이 높으며, 이는 재발 위험이 낮은 많은 부부(신생 돌연변이의 경우)가 이의 비침습성 때문에 선택할 것이기 때문입니다.

NGS와 같은 표준화되고 일반화 가능한 기술의 사용으로 가능해진 NGS에 의한 NIPD의 빠르고 광범위한 부상은 전국적으로 우리의 관행을 변화시킬 것입니다. 따라서 PrenatSafe 프로젝트는 거의 모든 배제 NIPD 적응증을 포괄하는 엑솜 염기서열 분석을 포함하는 자동화된 표준화 NGS 기술을 사용하여, 임상 실습에서 수행될 때 현재 표준 절차인 PCR에 의한 NIPD 또는 침습적 샘플링(융모막 생검 또는 양수천자)에 의한 PND와 비교하여 NGS에 의한 NIPD의 비용/편익 비율을 평가하는 것을 목표로 합니다.

이 프로젝트는 단일 표준화 기술을 사용한 전향적 엑솜 기반 NIPD의 첫 번째 비용-결과 분석입니다. 목표는 이 혁신적인 기술이 유익하고 경제적으로 실행 가능하다면 일상적인 실무로 전환하는 것입니다. 배제를 위한 엑솜 기반 NIPD는 ccffDNA 추출부터 염기서열 분석까지 완전히 자동화될 수 있습니다. 이는 인간 오류의 위험을 줄이고, 산전 진단의 요구 사항에 맞는 처리 시간을 가져옵니다. 성공한다면, 엑솜 기반 NIPD는 태아 손실 위험을 증가시키지 않으면서 침습적 PND에 대한 더 이른 대안이 될 것입니다. 이는 매우 많은 수의 적응증에 사용 가능하며, 프랑스의 다른 산전 진단 센터로 쉽게 이전될 수 있습니다.