Badanie wolnego DNA we krwi u dzieci i młodzieży z ostrą białaczką limfoblastyczną (CIRCALL)

Monitorowanie minimalnej choroby resztkowej (MRD) jest kluczowym czynnikiem prognostycznym w ostrej białaczce limfoblastycznej (ALL) u dzieci. Obecnie ocena MRD opiera się głównie na komórkowym DNA uzyskiwanym z aspiratów szpiku kostnego. Chociaż jest to podejście bardzo pouczające, ma ono ograniczenia, w tym konieczność stosowania inwazyjnych procedur oraz fakt, że odzwierciedla tylko kompartment szpiku kostnego.

Komórki nowotworowe uwalniają fragmenty genomowego DNA do krwiobiegu, znane jako krążące, wolne od komórek DNA (cfDNA). W guzach litych analiza cfDNA stała się cennym nieinwazyjnym biomarkerem do monitorowania choroby i odpowiedzi na leczenie. Ostatnie badania wykazały, że cfDNA jest wykrywalne w ALL u dzieci.

Niniejsze badanie ma na celu zbadanie, czy analiza cfDNA z osocza może stanowić alternatywne lub uzupełniające podejście do oceny MRD opartej na szpiku kostnym. cfDNA może lepiej odzwierciedlać globalne obciążenie nowotworowe w całym organizmie i umożliwiać częstsze monitorowanie podłużne podczas leczenia.

Głównym celem jest ocena korelacji między MRD mierzonym w cfDNA z osocza a MRD mierzonym w komórkowym DNA ze szpiku kostnego w dwóch kluczowych momentach leczenia: pod koniec indukcji (dzień 29) i pod koniec konsolidacji (dzień 71-78).

Drugorzędowe cele obejmują ocenę korelacji między komórkowym DNA z krwi obwodowej a MRD ze szpiku kostnego, opis ewolucji klonalnej przy użyciu cfDNA w trakcie leczenia i obserwacji, zbadanie zgodności zmian genomowych wykrytych w cfDNA i innych przedziałach biologicznych, ocenę wartości prognostycznej MRD w cfDNA dla ryzyka nawrotu i przeżycia wolnego od zdarzeń oraz scharakteryzowanie sygnatur fragmentomu i metylomu cfDNA u pacjentów w porównaniu ze zdrowymi kontrolami.

Badanie obejmie dzieci i młodzież z nowo rozpoznaną ALL leczone w dwóch pediatrycznych ośrodkach hematologii AP-HP, a także kohortę kontrolną zdrowych dzieci poddawanych typowaniu HLA w celu przeszczepu komórek macierzystych od rodzeństwa.