Оральный микробиом пациентов с вирусной инфекцией гепатита С

Полость рта человека является отличной средой обитания для более чем 600 видов бактерий, известных как микробиота полости рта, живущих в равновесии. Оральная микробиота играет важную роль в поддержании здоровья полости рта; однако, когда баланс в бактериальной популяции ротовой полости нарушается, известный как дисбактериоз, могут возникнуть оральные и системные заболевания.

Доказано, что некоторые системные заболевания связаны с дисбиозом полости рта. Среди этих заболеваний сахарный диабет, сердечно-сосудистые заболевания, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, аутоиммунные заболевания печени, печеночная энцефалопатия и инфекция гепатита В.

Вирус гепатита С (HCV) считается эпидемическим заболеванием в Египте; затрагивает около 10% египтян в возрасте от 15 до 59 лет. Инфекция ВГС прогрессивно повреждает печень, вызывая цирроз печени, печеночную энцефалопатию и может перейти в гепатоцеллюлярную карциному.

В связи с тем, что это серьезное заболевание, а также с многообещающими результатами недавно открытых противовирусных препаратов прямого действия при лечении хронического ВГС, медицина была озабочена поиском эффективных методов его ранней диагностики; с целью обеспечения раннего эффективного лечения и предотвращения серьезных осложнений.

Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что существует связь между дисбиотической микросредой полости рта и заболеванием печени через ось рот-печень-кишечный тракт. Были предприняты попытки исследовать сложную микробиоту полости рта. С появлением технологии полногеномного секвенирования стало возможным секвенировать геном микробов в так называемом микробиоме. Анализ генома сложной среды, содержащей несколько отдельных микробов, называется метагеномикой.

Оральный микробиом зависит от секвенирования 16S рРНК, чтобы получить карту всей ротовой микробиоты, доступной в ротовой полости. Технология секвенирования микробиома полости рта продвинулась от секвенирования по Сэнгеру, которое требовало поверхностного секвенирования, к секвенированию с высокой пропускной способностью в сочетании с биоинформационными инструментами, которые позволили всесторонне изучить сложный микробиом.

Дисбактериоз использовался для диагностики заболеваний печени с помощью анализа стула. Только в одном исследовании дисбактериоз ротовой полости использовался для диагностики печеночной энцефалопатии, а в другом — для тестирования инфекции гепатита В. Однако дисбиоз полости рта ранее не использовался для диагностики инфекции ВГС.

Понимание микробиома полости рта в состоянии здоровья и его изменения при заболевании может помочь предсказать ранние стадии заболевания и вылечить его до того, как произойдет дальнейшее повреждение и прогрессирование заболевания. Это также может помочь лечить каждого пациента в соответствии с конкретным микробиомом, обнаруженным с помощью персонализированной медицины. Кроме того, может быть введено целевое лечение конкретного микробиома каждого пациента с использованием конкретных пребиотиков и пробиотиков для поддержания бактериального симбиоза и, таким образом, помощи иммунной системе в ее непрерывной противовирусной битве.