Jämförande studie av den stora apanskötarens mikrobiom (SHAPES-CAP)

SHAPES-Captivity-studien syftar till att identifiera metagenomiska komponenter i tarmmikrobiomet som delas av människor och fångna människoapor som lever i närheten och i direkt daglig kontakt. SHAPES-Captivity är en förlängning av SHAPES-studien (finansierad av ANR 2014), som för närvarande pågår i centrala Afrika (Demokratiska republiken Kongo, Kamerun, Gabon). I Kamerun har utredarna samlat avföringsprover från gorillor, schimpanser och människor som använder samma skogsutrymme för att genomföra en analys av överlappningen av deras tarmmikrobiom. Resultaten av denna analys kommer att tolkas i ljuset av antropologiska och geografiska bevis som samlats in bland människor som bor i denna region. SHAPES-Captivity kommer att göra det möjligt för utredarna att använda samma tillvägagångssätt, men den här gången under förhållanden av människoapor. Utredarna kommer på så sätt att få data om överlappning av tarmmikrobiom mellan människoapor i fångenskap och mänskliga vårdare som arbetar i en kontrollerad miljö och i daglig, direkt kontakt. SHAPES-Captivity-studien kommer att ge en positiv kontroll, som så småningom kommer att jämföras med resultaten från SHAPES-studien. Även om flera studier har undersökt överlappningen mellan människoapor i tarmmikrobiom (Moeller et al. 2012; Moeller et al. 2016), har ingen av dessa studier undersökt människor som lever i nära anslutning till människoapor, varken i en naturlig eller fången miljö . Utredarna kommer att bestämma den fylogenetiska mångfalden av enterotyper (bakterier och virala) som delas mellan människor och människoapor, och kommer att koppla dessa resultat med deras deltagare-observationer av skötares aktiviteter (och kontakter) med dessa människoapor.