Étude comparative du microbiome gardien des grands singes (SHAPES-CAP)

L'étude SHAPES-Captivité vise à identifier les composants métagénomiques du microbiome intestinal partagés par les êtres humains et les grands singes captifs vivant à proximité et en contact direct et quotidien. Le SHAPES-Captivité est une extension de l'étude SHAPES (financée par l'ANR en 2014), actuellement en cours en Afrique centrale (République Démocratique du Congo, Cameroun, Gabon). Au Cameroun, les chercheurs ont collecté des échantillons de selles de gorilles, de chimpanzés et d'êtres humains utilisant le même espace forestier afin de procéder à une analyse du chevauchement de leur microbiome intestinal. Les résultats de cette analyse seront interprétés à la lumière des données anthropologiques et géographiques recueillies auprès des personnes vivant dans cette région. SHAPES-Captivity permettra aux chercheurs d'utiliser la même approche mais cette fois, dans des conditions de captivité de grands singes. Les chercheurs obtiendront ainsi des données concernant le chevauchement du microbiome intestinal entre les grands singes captifs et les soigneurs humains travaillant dans un environnement contrôlé et en contact direct quotidien. L'étude SHAPES-Captivity fournira un contrôle positif, qui sera éventuellement comparé aux résultats de l'étude SHAPES. Bien que plusieurs études aient étudié le chevauchement entre le microbiome intestinal humain et celui des grands singes (Moeller et al. 2012 ; Moeller et al. 2016), aucune de ces études n'a étudié les personnes vivant à proximité des grands singes, que ce soit dans un cadre naturel ou en captivité. . Les chercheurs détermineront la diversité phylogénétique des entérotypes (bactériens et viraux) partagés entre les êtres humains et les grands singes, et relieront ces résultats à leurs observations-participantes des activités (et contacts) des soigneurs avec ces grands singes.