Sydostasien encefalitprojekt (SEAe)

Bakgrund:

Encefalit definieras som en akut inflammation i centrala nervsystemet i samband med neurologisk dysfunktion. De vanligaste orsakerna är infektioner av antingen virus eller bakterier, även om parasiter och svampar också kan upptäckas ibland, särskilt hos patienter med nedsatt immunförsvar. På grund av hög dödlighet och långvariga neurologiska följdsjukdomar är encefalit ett folkhälsoproblem över hela världen. Rapporterade incidenser varierar mellan 3,5 och 7,4 fall per 100 000 patientår med högre incidens hos barn än hos vuxna. Olika hjärninflammatoriska utbrott har nyligen dykt upp i Asien, såsom det dödliga utbrottet av enterovirus 71 (EV71) som inträffade i mitten av 2012 i Kambodja och drabbade mycket små barn (de flesta under 3 år, alla under 12 år). I Asien där många av de möjliga etiologierna är av stora folkhälsoproblem (dvs. dengue, japansk encefalit, West Nile-virus, EV71), är akut encefalit bland de vanligaste och allvarligaste orsakerna till pediatrisk sjukhusvistelse.

Trots omfattande mikrobiologiska undersökningar och användningen av de mest avancerade molekylärbiologibaserade analyserna, identifieras ingen patogen för en betydande del av hjärninflammationspatienterna i både industriländer och utvecklingsländer (28-85 % av fallen är fortfarande obekräftade). Tidigare studier stödjer hypotesen att okända och ibland nya framväxande smittämnen kan vara ansvariga för fall av för närvarande okänd etiologi och talar starkt för ett intensivt försök att identifiera och karakterisera dem. Denna hypotes stärks också av den senaste tidens uppenbara ökning av nya infektionssjukdomar, av vilka många har kopplats till mänskliga aktiviteter som påverkar miljön och till spridningen av patogener till nya geografiska regioner. Ur detta perspektiv löper den sydostasiatiska regionen, en särskilt viktig hotspot för biologisk mångfald, stor risk för att nya patogener ska uppstå. Den växande mänskliga befolkningen, ökande urbanisering och frekvent kontakt med vilda djur och tama djur har faktiskt skapat nya möjligheter för uppkomsten av patogener som SARS i slutet av 2002, och i hög grad underlättat spridningen av infektionssjukdomar som H5N1 högpatogen aviär influensa virus sedan 2004 och H1N1 pandemiskt influensavirus 2009. Befolkningen i utvecklingsländerna i Sydostasien är särskilt utsatt för cirkulation av nya eller återkommande infektionsämnen och av denna anledning är övervakning och utredning av akut encefalitsyndrom i denna region av yttersta vikt för folkhälsan, både lokalt och globalt.

Övervaknings- och diagnostisk förmåga för hjärninflammation är fortfarande dålig och lider fortfarande av allvarliga brister i de flesta sydostasiatiska länder och utanför. Även om bördan av icke-infektiös encefalit i denna region återstår att fastställa, identifierar de bästa laboratorierna endast etiologiska smittämnen hos mindre än hälften av patienterna. Dessutom, på grund av frånvaron av tillförlitlig mikrobiologisk diagnostisk kapacitet i majoriteten av offentliga remisssjukhus, måste lokala läkare behandla akuta encefalitsyndrom mestadels empiriskt, med liten utvärdering av effektiviteten av deras kliniska tillvägagångssätt. Även om några av de vanligaste orsakerna till akut encefalitsyndrom kan förebyggas av vaccin, saknas systematiska data om bidraget från dessa sjukdomar och inga tillförlitliga data finns tillgängliga för att definiera bördan av dessa infektioner, för att beskriva hela det kliniska spektrumet och egenskaperna. av akuta infektioner i centrala nervsystemet och att utveckla diagnostiska och terapeutiska algoritmer för att förbättra patientvården. Dessutom, oavsett arten och omfattningen av encefalitbördan i Sydostasien och de kriterier som används för att bedöma den (dvs. sjuklighet, dödlighet, handikapp, påverkan på familjers budget eller försörjning), bärs denna börda främst av underprivilegierade befolkningar med begränsad tillgång till förebyggande och hälsovård.

Projektpartners Det föreslagna projektet är ett ambitiöst och multidisciplinärt forskningskonsortium som associerar: (i) nationella hälsomyndigheter i Kambodja, Laos PDR, Vietnam och Myanmar; (ii) Lokala större universitets- och kliniker (nationella sjukhus och provinsiella hälsocenter). (iii) centrala franska intressenter inom livs- och hälsovetenskap med forskningsaktiviteter som utförs i den sydostasiatiska regionen såsom: Institut Pasteur och Institut Pasteur International Network, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Inserm), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Aix-Marseille University - Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique (EHESP); och (iv) team från Southeast Asian Wellcome Trust Oxford University Major Overseas Programme.

Mål:

SEAe-projektet syftar till att minska sjukligheten och dödligheten i samband med infektiös encefalit i Sydostasien genom att förbättra diagnostik och medicinsk vård för patienter.

SEAe-projektets specifika mål är:

• Att fylla i de biomedicinska kunskapsluckorna gällande akut encefalitsyndrom;
• Att stärka sjukhuslaboratoriernas kapacitet för att förbättra hälsan genom att förbättra diagnostik och vård för patienter;
• Att identifiera okända patogener som är ansvariga för encefalit;
• Att dokumentera och analysera faktorer relaterade till kluster av fall av hjärninflammation som integrerar människors hälsa, djurhälsa och miljön genom en "One Health"-strategi;
• Att tillhandahålla tillförlitlig information och ett hållbart regionalt och subregionalt övervakningsnätverk till kliniker och folkhälsointressenter som kommer att hjälpa dem att bättre definiera förebyggande policyer, vaccinationsstrategier och bygga beredskap för nya smittsamma risker.

Befolkningsstudie: patient med misstänkt encefalit inlagd på 4 olika sjukhus, Kantha Bopha IV barnsjukhus, Phnom Penh, Kambodja, National pediatrics Hospital, Hanoi, Vietnam och Mahosot Hospital, Vientiane, Laos PDR, Yangon Children Hospital, Yangon, Myanmar. Inklusionskriterier anpassades från International Encephalitis Consortium 2013: alla patienter bör vara äldre än 28 dagar och uppvisa en förändrad mental status (dvs. förvirring eller oförmåga att prata, minskad eller förändrad medvetandenivå eller personlighetsförändring) som varar i mer än 24 timmar utan att någon annan orsak har identifierats. Dessa kriterier bör förknippas med minst ett av följande: (i) Feber (>=38°C axillär) under mindre än 72 timmar före eller efter presentation; (ii) anfall (feberkramper uteslutet); (iii) fokal neurologisk upptäckt.

Datainsamling:

Kliniska datainmatningar krävs för denna studie.

Datainmatningar:

En enskild datainmatningsperson (en läkare) anger klinisk information och fyller i ett pappersformulär vid intagningen, 24 timmar, vid utskrivningen och ett år efter utskrivningen och anger data i en OpenClinica (värd på CIRAD-servern, Montpellier, Frankrike) anonymiserad onlinedatabas.

Laboratoriedata läggs in i en anpassad ACCESS (Microsoft-databas). Resultaten läggs in i dedikerade flikar för de olika teknikerna.

En datahanterare dedikerad till studien ansvarar för databasen. CIRAD och Institut Pasteur delar på samägandet av databasen.

Den första statistiska analysen kommer att utföras i Institut Pasteur du Cambodge, Phnom Penh, under ansvar för epidemiologienheten. Kontinuerliga data kommer att beskrivas med beskrivande statistik, inklusive medelvärde ±SD och/eller median (intervall) som lämpligt och kategoriska data med frekvenser (%). Kategoriska data kommer att analyseras genom univariat analys med χ2 eller Fisher exakt test som lämpligt och kontinuerliga data genom icke-parametriskt Mann-Whitney test. Statistiska analyser kommer att involvera användning av R-programvara. Samband mellan kliniska, biologiska, radiologiska variabler, etiologier och utfall kommer att bedömas genom att använda en univariat och multivariat logistisk regressionsanalys för att identifiera determinanter för dåligt utfall.

Studiekalender

• Preliminärt startdatum för införandet: juli 2014
• Provisorisk inkluderingstid: 3 och ett halvt år
• Patientmedverkan: 1 år
• Studiens preliminära längd: 5 år
• Dataarkiveringstid: 15 år