Molekulární diagnostika bakteriálních infekcí a rezistence na antibiotika ve vzorcích krve a rektálních stěrech pomocí pokročilých metod sekvenování NGS (ARES_NGS)
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Fáze
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Itálie, 37024
- Nábor
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Kontakt:
- Elena Pomari
- Telefonní číslo: +390456013111
- E-mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Elena Pomari
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Pierantonio Orza
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Francesca Perandin
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Vzorky pacientů, u kterých byly v nemocnici IRCCS Sacro Cuore Don Calabria provedeny kontrolní testy hemokultury a multidrogové rezistence (MDR) v rektálních výtěrech
- Vzorky, u kterých byla podepsána Informace a souhlas s uchováním biologických vzorků pro výzkumné účely v Biobance Tropica popř.
- Vzorky, u kterých se po vynaložení veškerého přiměřeného úsilí nepodařilo získat podpis Informací a souhlas s uchováním biologických vzorků pro výzkumné účely v Tropica Biobank (např. pacienti na jednotce intenzivní péče, imobilní pacienti neschopní znamení nebo s vážnými poruchami vědomí).
Kritéria vyloučení:
- Absence údajů týkajících se pozitivity nebo negativity zárodků zájmu
- Absence skladovaného zbytkového materiálu
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Diagnostický
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Počet zbraní
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / ArmSkupina účastníků / Arm |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Jiný: NGS analýza
Budou použity zbytkové anonymizované vzorky skladované při -80°C v Tropica Biobank DITM au kterých byla dříve v DITM provedena diagnostická analýza na zárodečnou infekci pomocí hemokultury a sledování MDR v rutinním diagnostickém rektálním výtěru.
Z těchto zbytkových vzorků bude provedena extrakce DNA (s následnou analýzou kvality a kvantifikace nukleové kyseliny) pro následné analýzy NGS.
|
Analytický pipeline s technologií NGS vyvinutý ve studii GENRES bude použit pro identifikaci infikujících mikroorganismů a jejich rezistenci vůči lékům.
Za tímto účelem bude identifikována a přijata metoda sekvenování, která může získat genové sekvence o délce přibližně 75 bp a na platformě Illumina MiSeq.
Dále bude identifikován a přijat IT software a bioinformatické analýzy se specifickými parametry kontroly kvality (před a po vyrovnání odečtů) s cílem vyvinout systém IVD, který zahrnuje kompletní balíček sekvenačních souprav a softwaru.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Přítomnost mikroorganismů (pozitivní/negativní)
Časové okno: Základní linie
|
Přítomnost mikroorganismů identifikovaná technologií NGS.
|
Základní linie
|
|
Identifikace mikroorganismů
Časové okno: Základní linie
|
Identifikace mikroorganismů získaná pomocí technologie NGS.
|
Základní linie
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Identifikace genových mutací, které přenášejí rezistenci na antibiotika (rezistentní/citlivé)
Časové okno: Základní linie
|
Výsledky (rezistentní/citlivé) získané pomocí technologie NGS při identifikaci genových mutací, které přenášejí rezistenci na antibiotika.
|
Základní linie
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 2022-13
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Analýza NGS
-
NCT07010211Zatím nenabírámeChronická obstrukční plicní nemoc (CHOPN)
-
NCT06310317NáborPoruchou autistického spektra | Autismus
-
NCT02473588Neznámý
-
NCT05614206DokončenoPoruchou autistického spektra | Včasná intervence
-
NCT05476055Zatím nenabírámePředčasně narozené děti | Kojenci NICU | Konvenční NBS-pozitivní kojenci
-
NCT05216068DokončenoOpakovaný potrat | Translokace chromozomů | Genetické poruchy v těhotenství
-
NCT06729944NáborHepatektomie | Stenóza žlučovodu | NGS
-
NCT05076071NáborPediatrické, solidní nádory, NGS