Molekylær diagnostik af bakterielle infektioner og antibiotikaresistens i blodprøver og rektale podninger ved hjælp af avancerede NGS-sekventeringsmetoder (ARES_NGS)
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italien, 37024
- Rekruttering
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Kontakt:
- Elena Pomari
- Telefonnummer: +390456013111
- E-mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Ledende efterforsker:
- Elena Pomari
-
Underforsker:
- Pierantonio Orza
-
Underforsker:
- Francesca Perandin
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Prøver af patienter, for hvem blodkultur og Multi Drug Resistant (MDR) overvågningstest blev udført i rektale podninger på IRCCS Sacro Cuore Don Calabria Hospital
- Prøver, for hvilke oplysningerne og samtykket til bevarelse af biologiske prøver til forskningsformål er underskrevet i Tropica Biobank eller
- Prøver, for hvilke det efter alle rimelige anstrengelser ikke var muligt at opnå underskrift af oplysningerne og samtykke til bevarelse af biologiske prøver til forskningsformål i Tropica Biobank (f.eks. patienter på intensiv, immobiliserede patienter, der ikke er i stand til at underskrive eller med alvorlige bevidsthedsændringer).
Eksklusionskriterier:
- Fravær af data relateret til positivitet eller negativitet til kim af interesse
- Fravær af lagret restmateriale
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Antal våben
Våben og indgreb
Deltagergruppe / ArmDeltagergruppe / Arm |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Andet: NGS analyse
Resterende anonymiserede prøver opbevaret ved -80°C i Tropica Biobank af DITM, og for hvilke diagnostisk analyse for kiminfektion tidligere er blevet udført på DITM ved blodkultur og MDR-overvågning i rutinediagnostisk rektal podning, vil blive brugt.
DNA-ekstraktion vil blive udført på disse resterende prøver (med efterfølgende kvalitets- og kvantificeringsanalyse af nukleinsyren) til efterfølgende NGS-analyser.
|
En analytisk pipeline med NGS-teknologi udviklet i GENRES-undersøgelsen vil blive brugt til identifikation af inficerende mikroorganismer og den lægemiddelresistens, de bærer.
Til dette formål vil en sekventeringsmetode blive identificeret og vedtaget, som kan opnå gensekvenser på cirka 75 bp i længden og på Illumina MiSeq-platformen.
Ydermere vil IT-software og bioinformatikanalyser med specifikke kvalitetskontrolparametre (før- og efterjustering af læsninger) blive identificeret og vedtaget for at udvikle et IVD-system, der inkluderer en komplet pakke af sekventeringskit og software.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Tilstedeværelse af mikroorganismer (positiv/negativ)
Tidsramme: Baseline
|
Tilstedeværelse af mikroorganismer identificeret af NGS-teknologi.
|
Baseline
|
|
Identifikation af mikroorganismer
Tidsramme: Baseline
|
Mikroorganisme identifikation opnået ved hjælp af NGS teknologi.
|
Baseline
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Identifikation af genmutationer, der overfører resistens over for antibiotika (resistente/følsomme)
Tidsramme: Baseline
|
Resultater (resistente/følsomme) opnået ved hjælp af NGS-teknologi til identifikation af genmutationer, der overfører resistens over for antibiotika.
|
Baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2022-13
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Resistens bakteriel
-
NCT07326540RekrutteringHospital Acquired Bacterial Pneumonia (HABP) | Ventilator Associated Bacterial Pneumonia (VABP) | Acinetobacter Baumannii-calcoaceticus kompleks | Colistin-resistent ABC
-
NCT07431307Ikke rekrutterer endnuMeningitis, bakteriel | Hospital Acquired Bacterial Pneumonia (HABP) | Ventilator Associated Bacterial Pneumonia (VABP) | Blodstrømsinfektion | Ventrikulitis, Infektiøs
-
NCT04215991AfsluttetGram-negative bakterielle infektioner | Kompliceret urinvejsinfektion (cUTI) | Hospital Acquired Bacterial Pneumonia (HABP) | Ventilator Associated Bacterial Pneumonia (VABP)
Kliniske forsøg med NGS Analyse
-
NCT07356999Rekruttering
-
NCT04872517Rekruttering
-
NCT07552051RekrutteringRettsmedicinsk Tandlægevidenskab | Bidanalyse
-
NCT04129749Trukket tilbage
-
NCT05476055Ikke rekrutterer endnuFor tidligt fødte spædbørn | NICU spædbørn | Konventionelle NBS-positive spædbørn
-
NCT05216068AfsluttetTilbagevendende abort | Kromosomtranslokation | Genetiske lidelser under graviditet
-
NCT06729944RekrutteringHepatektomi | Stenose af galdegang | NGS
-
NCT05076071RekrutteringPædiatrisk, solide tumorer, NGS