Diagnóstico molecular de infecções bacterianas e resistência a antibióticos em amostras de sangue e esfregaços retais usando métodos avançados de sequenciamento NGS (ARES_NGS)
Visão geral do estudo
Status
Status
Condições
Condições
Intervenção / Tratamento
Intervenção / Tratamento
Tipo de estudo
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Inscrição
Estágio
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Locais de estudo
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Itália, 37024
- Recrutamento
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Contato:
- Elena Pomari
- Número de telefone: +390456013111
- E-mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Investigador principal:
- Elena Pomari
-
Subinvestigador:
- Pierantonio Orza
-
Subinvestigador:
- Francesca Perandin
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critério de inclusão:
- Amostras de pacientes para os quais foram realizados testes de hemocultura e vigilância multidroga resistente (MDR) em esfregaços retais no Hospital IRCCS Sacro Cuore Don Calabria
- Amostras para as quais a Informação e consentimento para a conservação de amostras biológicas para fins de pesquisa foram assinados no Tropica Biobank ou
- Amostras para as quais, após todos os esforços razoáveis, não foi possível obter a assinatura da Informação e consentimento para a conservação de amostras biológicas para fins de investigação no Biobanco Tropica (ex. pacientes em cuidados intensivos, pacientes imobilizados, incapazes de sinalizar ou com alterações graves de consciência).
Critério de exclusão:
- Ausência de dados relativos à positividade ou negatividade aos germes de interesse
- Ausência de material residual armazenado
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Número de braços
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / BraçoGrupo de Participantes / Braço |
Intervenção / TratamentoIntervenção / Tratamento |
|---|---|
|
Outro: Análise NGS
Serão utilizadas amostras residuais anonimizadas armazenadas a -80°C no Tropica Biobank do DITM e para as quais a análise diagnóstica de infecção por germes foi previamente realizada no DITM por hemocultura e vigilância MDR em swab retal diagnóstico de rotina.
A extração de DNA será realizada nessas amostras residuais (com posterior análise de qualidade e quantificação do ácido nucleico) para posteriores análises NGS.
|
Um pipeline analítico com tecnologia NGS desenvolvido no estudo GENRES será utilizado para a identificação de microrganismos infectantes e a resistência aos medicamentos que eles carregam.
Para tanto, será identificado e adotado um método de sequenciamento que poderá obter sequências genéticas de aproximadamente 75 pb de comprimento e na plataforma Illumina MiSeq.
Além disso, serão identificados e adotados softwares de TI e análises de bioinformática com parâmetros específicos de controle de qualidade (pré e pós-alinhamento de leituras), a fim de desenvolver um sistema IVD que inclua um pacote completo de kits de sequenciamento e software.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Presença de microrganismos (positivo/negativo)
Prazo: Linha de base
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Presença de microrganismos identificada pela tecnologia NGS.
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Linha de base
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Identificação de microrganismos
Prazo: Linha de base
|
Identificação de microrganismos obtida através da tecnologia NGS.
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Linha de base
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Medidas de resultados secundários
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
|
Identificação de mutações genéticas que transmitem resistência a antibióticos (resistente/suscetível)
Prazo: Linha de base
|
Resultados (resistentes/suscetíveis) obtidos através da tecnologia NGS na identificação de mutações genéticas que conferem resistência a antibióticos.
|
Linha de base
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Patrocinador
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Início do estudo
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão Primária
Conclusão do estudo (Estimado)
Conclusão do estudo
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Primeira postagem
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última Atualização Postada
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
Outros números de identificação do estudo
- 2022-13
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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