Diagnostyka molekularna zakażeń bakteryjnych i oporności na antybiotyki w próbkach krwi i wymazach z odbytu przy użyciu zaawansowanych metod sekwencjonowania NGS (ARES_NGS)
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Faza
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Włochy, 37024
- Rekrutacyjny
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Kontakt:
- Elena Pomari
- Numer telefonu: +390456013111
- E-mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Główny śledczy:
- Elena Pomari
-
Pod-śledczy:
- Pierantonio Orza
-
Pod-śledczy:
- Francesca Perandin
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dziecko
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Próbki pacjentów, u których w szpitalu IRCCS Sacro Cuore Don Calabria w szpitalu IRCCS przeprowadzono badania kontrolne w kierunku wielolekooporności (MDR) w wymazach z odbytu
- Próbki, dla których została podpisana Informacja i zgoda na konserwację próbek biologicznych do celów badawczych w Biobanku Tropica lub
- Próbki, dla których mimo wszelkich uzasadnionych starań nie udało się uzyskać podpisu Informacji i zgody na konserwację próbek biologicznych do celów badawczych w Biobanku Tropica (np. pacjenci na oddziale intensywnej terapii, unieruchomieni pacjenci niezdolni do chodzenia lub z poważnymi zaburzeniami świadomości).
Kryteria wyłączenia:
- Brak danych dotyczących pozytywnego lub negatywnego nastawienia do drobnoustrojów będących przedmiotem zainteresowania
- Brak składowanych resztek materiału
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Diagnostyczny
- Przydział: Nie dotyczy
- Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Liczba ramion
Broń i interwencje
Grupa uczestników / ArmGrupa uczestników / Arm |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Inny: Analiza NGS
Wykorzystane zostaną pozostałe zanonimizowane próbki przechowywane w temperaturze -80°C w Tropica Biobank DITM, dla których wcześniej w DITM przeprowadzono analizę diagnostyczną pod kątem zakażenia bakteryjnego na podstawie posiewu krwi i monitoringu MDR w rutynowym diagnostycznym wymazie z odbytu.
Z tych pozostałości próbek zostanie przeprowadzona ekstrakcja DNA (z późniejszą analizą jakości i ilościowego kwasu nukleinowego) na potrzeby kolejnych analiz NGS.
|
Rurociąg analityczny wykorzystujący technologię NGS opracowaną w ramach badania GENRES zostanie wykorzystany do identyfikacji zakażających mikroorganizmów i niesionej przez nie lekooporności.
W tym celu zostanie zidentyfikowana i przyjęta metoda sekwencjonowania, która umożliwi otrzymanie sekwencji genów o długości około 75 bp i na platformie Illumina MiSeq.
Ponadto zostaną zidentyfikowane i zastosowane analizy oprogramowania informatycznego i bioinformatyki z określonymi parametrami kontroli jakości (przed i po wyrównaniu odczytów) w celu opracowania systemu IVD obejmującego kompletny pakiet zestawów do sekwencjonowania i oprogramowania.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Obecność mikroorganizmów (dodatnia/ujemna)
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Obecność mikroorganizmów zidentyfikowana za pomocą technologii NGS.
|
Linia bazowa
|
|
Identyfikacja mikroorganizmów
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Identyfikacja mikroorganizmów uzyskana przy użyciu technologii NGS.
|
Linia bazowa
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Identyfikacja mutacji genów przenoszących oporność na antybiotyki (oporne/wrażliwe)
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Wyniki (oporne/wrażliwe) uzyskane przy użyciu technologii NGS w identyfikacji mutacji genów przenoszących oporność na antybiotyki.
|
Linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2022-13
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Analiza NGS
-
NCT00125242ZakończonyZaburzenia językowe | Afazja | Zaburzenia mowy
-
NCT04489758ZakończonyZaciskające zapalenie oskrzelików
-
NCT05476055Jeszcze nie rekrutacjaWcześniaki | NICU Niemowlęta | Konwencjonalne niemowlęta NBS-dodatnie
-
NCT05216068ZakończonyNawracające poronienia | Translokacja chromosomów | Zaburzenia genetyczne w ciąży
-
NCT06729944RekrutacyjnyHepatektomia | Zwężenie przewodu żółciowego | NGS
-
NCT05076071RekrutacyjnyPediatria, guzy lite, NGS
-
NCT02767700ZakończonyGruczolakorak przewodowy trzustki
-
NCT05621291RekrutacyjnyOstra białaczka limfoblastyczna | Piłka