Moleculaire diagnostiek van bacteriële infecties en antibioticaresistentie in bloedmonsters en rectale uitstrijkjes met behulp van geavanceerde NGS-sequencingmethoden (ARES_NGS)
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Interventie / Behandeling
Interventie / Behandeling
Studietype
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Inschrijving
Fase
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italië, 37024
- Werving
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Contact:
- Elena Pomari
- Telefoonnummer: +390456013111
- E-mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Hoofdonderzoeker:
- Elena Pomari
-
Onderonderzoeker:
- Pierantonio Orza
-
Onderonderzoeker:
- Francesca Perandin
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Monsters van patiënten bij wie bloedkweek- en multidrugsresistente (MDR) surveillancetests zijn uitgevoerd in rectale uitstrijkjes in het IRCCS Sacro Cuore Don Calabria-ziekenhuis
- Monsters waarvoor de Informatie en toestemming voor het bewaren van biologische monsters voor onderzoeksdoeleinden is ondertekend bij de Tropica Biobank of
- Monsters waarvoor het, na alle redelijke inspanningen, niet mogelijk was om de handtekening van de Informatie te verkrijgen en toestemming te geven voor het bewaren van biologische monsters voor onderzoeksdoeleinden bij de Tropica Biobank (bijv. patiënten op de intensive care, geïmmobiliseerde patiënten die niet kunnen tekenen of met ernstige bewustzijnsveranderingen).
Uitsluitingscriteria:
- Ontbreken van gegevens met betrekking tot positiviteit of negativiteit voor de kiemen van interesse
- Afwezigheid van opgeslagen restmateriaal
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Aantal wapens
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / ArmDeelnemersgroep / Arm |
Interventie / BehandelingInterventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: NGS-analyse
Er zal gebruik worden gemaakt van resterende geanonimiseerde monsters die bij -80 ° C zijn opgeslagen in de Tropica Biobank van het DITM en waarvoor eerder diagnostische analyses voor kieminfecties zijn uitgevoerd bij het DITM door middel van bloedkweek en MDR-surveillance in routinematig diagnostisch rectaal uitstrijkje.
Op deze restmonsters zal DNA-extractie worden uitgevoerd (met daaropvolgende kwaliteits- en kwantificeringsanalyse van het nucleïnezuur) voor daaropvolgende NGS-analyses.
|
Een analytische pijplijn met NGS-technologie ontwikkeld in de GENRES-studie zal worden gebruikt voor de identificatie van infecterende micro-organismen en de medicijnresistentie die zij met zich meebrengen.
Voor dit doel zal een sequentiemethode worden geïdentificeerd en toegepast die gensequenties van ongeveer 75 bp lang kan verkrijgen op het Illumina MiSeq-platform.
Bovendien zullen IT-software en bio-informatica-analyses met specifieke kwaliteitscontroleparameters (pre- en post-alignment van reads) worden geïdentificeerd en toegepast om een IVD-systeem te ontwikkelen dat een compleet pakket van sequencing-kits en software omvat.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aanwezigheid van micro-organismen (positief/negatief)
Tijdsspanne: Basislijn
|
Aanwezigheid van micro-organismen geïdentificeerd door NGS-technologie.
|
Basislijn
|
|
Identificatie van micro-organismen
Tijdsspanne: Basislijn
|
Identificatie van micro-organismen verkregen met behulp van NGS-technologie.
|
Basislijn
|
Secundaire uitkomstmaten
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Identificatie van genmutaties die resistentie tegen antibiotica overbrengen (resistent/gevoelig)
Tijdsspanne: Basislijn
|
Resultaten (resistent/gevoelig) verkregen met behulp van NGS-technologie bij de identificatie van genmutaties die resistentie tegen antibiotica overbrengen.
|
Basislijn
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Geschat)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Geschat)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- 2022-13
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op NGS-analyse
-
NCT06918457Nog niet aan het werven
-
NCT02410408Voltooid
-
NCT04489758VoltooidConstrictieve bronchiolitis
-
NCT07144306WervingMelanoom van huidkanker
-
NCT05476055Nog niet aan het wervenPremature baby's | NICU-zuigelingen | Conventionele NBS-positieve zuigelingen
-
NCT05216068VoltooidTerugkerende miskraam | Chromosoomtranslocatie | Genetische aandoeningen tijdens de zwangerschap
-
NCT06729944WervingHepatectomie | Stenose van de galwegen | NGS
-
NCT05076071WervingPediatrische, solide tumoren, NGS