Molekylær diagnostikk av bakterieinfeksjoner og antibiotikaresistens i blodprøver og rektale vattpinner ved bruk av avanserte NGS-sekvenseringsmetoder (ARES_NGS)
Studieoversikt
Status
Status
Forhold
Forhold
Intervensjon / Behandling
Intervensjon / Behandling
Studietype
Studietype
Registrering (Antatt)
Registrering
Fase
Fase
- Ikke aktuelt
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italia, 37024
- Rekruttering
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Ta kontakt med:
- Elena Pomari
- Telefonnummer: +390456013111
- E-post: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Hovedetterforsker:
- Elena Pomari
-
Underetterforsker:
- Pierantonio Orza
-
Underetterforsker:
- Francesca Perandin
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Prøver av pasienter for hvem blodkultur og multimedisinresistente (MDR) overvåkingstester ble utført i rektale vattpinner ved IRCCS Sacro Cuore Don Calabria Hospital
- Prøver der informasjonen og samtykket til bevaring av biologiske prøver for forskningsformål er signert i Tropica Biobank eller
- Prøver som, etter alle rimelige anstrengelser, ikke var mulig å få signaturen til informasjonen og samtykke til bevaring av biologiske prøver for forskningsformål ved Tropica Biobank (f.eks. pasienter på intensivavdeling, immobiliserte pasienter som ikke kan signere eller med alvorlige bevissthetsendringer).
Ekskluderingskriterier:
- Fravær av data relatert til positivitet eller negativitet til kimene av interesse
- Fravær av lagret restmateriale
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
- Masking: Ingen (Open Label)
Antall våpen
Våpen og intervensjoner
Deltakergruppe / ArmDeltakergruppe / Arm |
Intervensjon / BehandlingIntervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Annen: NGS analyse
Anonymiserte gjenværende prøver lagret ved -80°C i Tropica Biobank av DITM og som tidligere har blitt utført diagnostisk analyse for bakterieinfeksjon ved DITM ved blodkultur og MDR-overvåking i rutinemessig diagnostisk rektal vattpinne.
DNA-ekstraksjon vil bli utført på disse restprøvene (med påfølgende kvalitets- og kvantifiseringsanalyse av nukleinsyren) for påfølgende NGS-analyser.
|
En analytisk pipeline med NGS-teknologi utviklet i GENRES-studien vil bli brukt for identifisering av smittende mikroorganismer og medikamentresistensen de bærer på.
For dette formålet vil en sekvenseringsmetode bli identifisert og tatt i bruk som kan oppnå gensekvenser på omtrent 75 bp i lengde og på Illumina MiSeq-plattformen.
Videre vil IT-programvare og bioinformatikkanalyser med spesifikke kvalitetskontrollparametere (pre- og post-justering av lesninger) identifiseres og tas i bruk for å utvikle et IVD-system som inkluderer en komplett pakke med sekvenseringssett og programvare.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Tilstedeværelse av mikroorganismer (positiv/negativ)
Tidsramme: Grunnlinje
|
Tilstedeværelse av mikroorganismer identifisert av NGS-teknologi.
|
Grunnlinje
|
|
Identifikasjon av mikroorganismer
Tidsramme: Grunnlinje
|
Identifikasjon av mikroorganismer oppnådd ved bruk av NGS-teknologi.
|
Grunnlinje
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Identifikasjon av genmutasjoner som gir resistens mot antibiotika (resistente/mottakelige)
Tidsramme: Grunnlinje
|
Resultater (resistente/følsomme) oppnådd ved bruk av NGS-teknologi for identifisering av genmutasjoner som formidler resistens mot antibiotika.
|
Grunnlinje
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Sponsor
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær fullføring (Antatt)
Primær fullføring
Studiet fullført (Antatt)
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- 2022-13
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på NGS Analyse
-
NCT04872517Rekruttering
-
NCT04129749Tilbaketrukket
-
NCT05476055Har ikke rekruttert ennåPremature spedbarn | NICU spedbarn | Konvensjonelle NBS-positive spedbarn
-
NCT05216068FullførtGjentatt spontanabort | Kromosomtranslokasjon | Genetiske lidelser i svangerskapet
-
NCT06729944RekrutteringHepatektomi | Stenose av gallegang | NGS
-
NCT05076071RekrutteringPediatrisk, solide svulster, NGS
-
NCT02767700FullførtDuktalt adenokarsinom i bukspyttkjertelen