Bakteeri-infektioiden ja antibioottiresistenssin molekyylidiagnostiikka verinäytteissä ja peräsuolen näytteessä kehittyneillä NGS-sekvensointimenetelmillä (ARES_NGS)
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Ilmoittautuminen
Vaihe
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italia, 37024
- Rekrytointi
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Elena Pomari
- Puhelinnumero: +390456013111
- Sähköposti: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Päätutkija:
- Elena Pomari
-
Alatutkija:
- Pierantonio Orza
-
Alatutkija:
- Francesca Perandin
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Näytteet potilaista, joille tehtiin veriviljely- ja MDR-valvontatestit peräsuolen pyyhkäisynä IRCCS Sacro Cuore Don Calabrian sairaalassa
- Näytteet, joista tiedot ja suostumus biologisten näytteiden säilyttämiseen tutkimustarkoituksiin on allekirjoitettu Tropica Biopankissa tai
- Näytteet, joille ei kaikkien kohtuullisten ponnistelujen jälkeen ollut mahdollista saada Tietojen allekirjoitusta ja suostumusta biologisten näytteiden säilyttämiseen tutkimustarkoituksiin Tropica Biobankissa (esim. tehohoidossa olevat potilaat, liikkumattomat potilaat, jotka eivät pysty havaitsemaan oireita tai joilla on vakavia tajunnan muutoksia).
Poissulkemiskriteerit:
- Positiivisuuteen tai negatiivisuuteen liittyvän tiedon puuttuminen kiinnostavien bakteerien suhteen
- Varastoidun jäännösmateriaalin puuttuminen
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseiden lukumäärä
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / ArmOsallistujaryhmä / Arm |
Interventio / HoitoInterventio / Hoito |
|---|---|
|
Muut: NGS-analyysi
Anonymisoidut jäännösnäytteet, joita on säilytetty -80 °C:ssa DITM:n Tropica Biobankissa ja joille on aiemmin suoritettu DITM:ssä diagnostinen analyysi bakteeritartunnan varalta veriviljelmällä ja MDR-valvonnalla rutiininomaisessa diagnostisessa peräsuolen vanupuikolla.
Näille jäännösnäytteille suoritetaan DNA-uutto (ja sen jälkeen nukleiinihapon laatu- ja kvantifiointianalyysi) myöhempiä NGS-analyysejä varten.
|
Infektoivien mikro-organismien ja niiden kantaman lääkeresistenssin tunnistamiseen käytetään GENRES-tutkimuksessa kehitettyä analyyttistä putkilinjaa NGS-teknologialla.
Tätä tarkoitusta varten tunnistetaan ja otetaan käyttöön sekvensointimenetelmä, jolla voidaan saada noin 75 bp:n pituisia geenisekvenssejä Illumina MiSeq -alustalla.
Lisäksi tunnistetaan ja otetaan käyttöön IT-ohjelmistoja ja bioinformatiikkaanalyysejä, joissa on tietyt laadunvalvontaparametrit (lukemien kohdistaminen ennen ja jälkeen), jotta voidaan kehittää IVD-järjestelmä, joka sisältää täydellisen sekvensointisarjoja ja ohjelmistoja.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mikro-organismien esiintyminen (positiivinen/negatiivinen)
Aikaikkuna: Perustaso
|
Mikro-organismien esiintyminen tunnistettu NGS-tekniikalla.
|
Perustaso
|
|
Mikro-organismien tunnistaminen
Aikaikkuna: Perustaso
|
Mikro-organismien tunnistus saatu käyttämällä NGS-tekniikkaa.
|
Perustaso
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Antibioottiresistenssin välittävien geenimutaatioiden tunnistaminen (resistentti/herkkä)
Aikaikkuna: Perustaso
|
Tulokset (resistentit/herkät), jotka on saatu käyttämällä NGS-tekniikkaa antibioottiresistenssin välittävien geenimutaatioiden tunnistamisessa.
|
Perustaso
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2022-13
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Resistenssi Bakteeri
-
NCT07452588Ei vielä rekrytointiaTarttuva keratiitti | Adjuvant Treatment Bacterial Infectious Keratitis | Natriklooridi 5 % liuos
Kliiniset tutkimukset NGS-analyysi
-
NCT02916524Rekrytointi
-
NCT00125242ValmisKielihäiriöt | Afasia | Puhehäiriöt
-
NCT06310317RekrytointiAutismispektrihäiriö | Autismi
-
NCT02473588Tuntematon
-
NCT04872517Rekrytointi
-
NCT05476055Ei vielä rekrytointiaKeskoset | NICU vauvat | Perinteiset NBS-positiiviset lapset
-
NCT05216068ValmisToistuva keskenmeno | Kromosomien translokaatio | Geneettiset häiriöt raskauden aikana
-
NCT06729944RekrytointiMaksan poisto | Sappitiehyen ahtauma | NGS
-
NCT05076071RekrytointiPediatriset, kiinteät kasvaimet, NGS