Diagnostica molecolare delle infezioni batteriche e della resistenza agli antibiotici in campioni di sangue e tamponi rettali utilizzando metodi avanzati di sequenziamento NGS (ARES_NGS)
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Iscrizione
Fase
Fase
- Non applicabile
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italia, 37024
- Reclutamento
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Contatto:
- Elena Pomari
- Numero di telefono: +390456013111
- Email: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Investigatore principale:
- Elena Pomari
-
Sub-investigatore:
- Pierantonio Orza
-
Sub-investigatore:
- Francesca Perandin
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Bambino
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Campioni di pazienti per i quali sono state effettuate emocolture e test di sorveglianza Multi Drug Resistente (MDR) su tamponi rettali presso l'IRCCS Ospedale Sacro Cuore Don Calabria
- Campioni per i quali è stata firmata l'Informativa e il consenso alla conservazione dei campioni biologici a fini di ricerca presso la Tropica Biobank o
- Campioni per i quali, dopo ogni ragionevole sforzo, non è stato possibile ottenere la firma dell'Informativa e il consenso alla conservazione dei campioni biologici per scopi di ricerca presso la Tropica Biobank (es. pazienti in terapia intensiva, pazienti immobilizzati, incapaci di firmare o con gravi alterazioni della coscienza).
Criteri di esclusione:
- Assenza di dati relativi a positività o negatività ai germi di interesse
- Assenza di materiale residuo stoccato
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Scopo principale: Diagnostico
- Assegnazione: N / A
- Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
- Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)
Numero di armi
Armi e interventi
Gruppo di partecipanti / ArmGruppo di partecipanti / Arm |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
|---|---|
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Altro: Analisi NGS
Verranno utilizzati campioni residui anonimizzati conservati a -80°C presso la Tropica Biobank del DITM e per i quali l'analisi diagnostica per l'infezione da germi è stata precedentemente effettuata presso il DITM mediante emocoltura e sorveglianza MDR nel tampone rettale diagnostico di routine.
Su questi campioni residui verrà effettuata l'estrazione del DNA (con successiva analisi di qualità e quantificazione dell'acido nucleico) per le successive analisi NGS.
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Una pipeline analitica con tecnologia NGS sviluppata nello studio GENRES verrà utilizzata per identificare i microrganismi infettanti e la resistenza ai farmaci che trasportano.
A questo scopo verrà individuato e adottato un metodo di sequenziamento in grado di ottenere sequenze geniche di circa 75 bp di lunghezza e su piattaforma Illumina MiSeq.
Inoltre, verranno identificati e adottati software IT e analisi bioinformatiche con specifici parametri di controllo della qualità (pre e post-allineamento delle letture) al fine di sviluppare un sistema IVD che includa un pacchetto completo di kit di sequenziamento e software.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Presenza di microrganismi (positivo/negativo)
Lasso di tempo: Linea di base
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Presenza di microorganismi identificata mediante tecnologia NGS.
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Linea di base
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Identificazione dei microrganismi
Lasso di tempo: Linea di base
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Identificazione dei microrganismi ottenuta utilizzando la tecnologia NGS.
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Linea di base
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Identificazione delle mutazioni genetiche che trasmettono resistenza agli antibiotici (resistente/sensibile)
Lasso di tempo: Linea di base
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Risultati (resistente/suscettibile) ottenuti utilizzando la tecnologia NGS nell'identificazione di mutazioni genetiche che trasmettono resistenza agli antibiotici.
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Linea di base
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Stimato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 2022-13
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
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